选择需要Label的对象 | 然后点击对象上的L按钮,根据需要,可以标记残基的名字,原子的名字,范德华半径、元素的名字等。 L->residue 在α碳原子上标记其残基名字和编号 (常用) L->residue name 在所有原子上标记残基名字 (不常用) L->clear 删除该对象上所有的Label L->element symbol 显示对象上所有原子的元素...
1. L->residue 在α碳原子上标记其残基名字和编号 (常用) 2. L->residue name 在所有原子上标记残基名字 (不常用) 3. L->clear 删除该对象上所有的Label 4. L->element symbol 显示对象上所有原子的元素名字 5. L->vdw radius 产看原子的范德华半径 ...
选择需要Label的对象 | 然后点击对象上的L按钮,根据需要,可以标记残基的名字,原子的名字,范德华半径、元素的名字等。 L->residue 在α碳原子上标记其残基名字和编号 (常用) L->residue name 在所有原子上标记残基名字 (不常用) L->clear 删除该对象上所有的Label L->element symbol 显示对象上所有原子的元素...
- 旋转视角:`rotate view_name` - 缩放视角:`zoom view_name` - 链操作: - 选链:`select chain "链名称"` - 隐藏链:`hide chain "链名称"` - 链互换:`chain swap "链名称 1" "链名称 2"` - 残基操作: - 选残基:`select residue "残基名称"` - 隐藏残基:`hide residue "残基名称"` - 残基...
L->residue在a碳原子上标记其残基名字和编号(常用) L->residue name 在所有原子上标记残基名字(不常用) L->clear 删除该对象上所有的Label L->element symbol显示对象上所有原子的元素名字 L->vdw radius产看原子的范德华半径 对于蛋白醛糖还原酶(PDB ID:4HBK),我们在UniProt 数据库中查询得到,其口袋中的重...
L->residue name 在所有原子上标记残基名字 (不常用) L->clear 删除该对象上所有的Label L->element symbol 显示对象上所有原子的元素名字 L->vdw radius 产看原子的范德华半径 对于蛋白醛糖还原酶(PDB ID: 4HBK),我们在UniProt 数据库中查询得到,其口袋中的重要残基有:TYR48、LYS77 和 HIS110。我们对这...
name n. Atom-name-list 蛋白和核酸中至多4字母的原子符号 PyMOL>select carbons,name ca+cb+cg resn r. Residue-name-list 3字母的氨基酸符号 PyMOL>select aas,resn asp+glu+asn+gln 或至多2字母的核苷酸符号 PyMOL>select bases,resn a+g resi i. Residue-identifier-list 至多4位数的残基号 PyMOL...
Additionally, the residue names can be changed for bonded cysteines:alter cys/,name=‘CYX’or for specific residuesalter 24+26+56+99/,name=‘CYX’Warren DeLanoAdding hydrogen bondsRegarding H-bonds. There isn’t a built-in function yet, but you can show H-bonds between twoobjects using ...
interfaceResidue object_name, chain R, chain A + chain B + chain C + chain N select hydrophobes,(resn ala+gly+val+ile+leu+phe+met+pro+trp) show sticks, (interface and hydrophobes and (!name c+n+o)) 分两步,首先找到相互作用界面,其次选中疏水氨基酸并展示侧链。
10、是residue id的缩写。输入命令并回车后,结构上会显示出一些粉红色的点,7cel框下面会出现一个geng框。但是你还是没看到212GLU的样子,怎么办呢?点击geng框后S按键中的sticks,212GLU残基就会显示出sticks模式,再点击C按键中的oranges改为桔色,如下图。这一切也可用命令实现 show sticks,gengcolor orange,geng ...