R (Clip):右键滑动调整裁剪面位置。感觉和无修饰时候的Wheel (Slab)效果一样,不改变坐标。 Wheel (MovZ):感觉和无修饰键时候的R (MovZ)效果一样。用于缩放视图(沿 Z 轴移动),不改变坐标。 (6)单击功能 (SnglClk) L (PkAt):单击左键拾取原子。还提供了该原子所属分子,残基,链,对象的选择选项。 M ...
set solvent_radius, 0.8 绘制蛋白截面图clip 需要ray后才能看到截面的效果。 as surface clip near,-10 ray 注解 为了获得想要的效果,多次尝试clip的数值。 也可以通过滚动数据获得切面 设置截面的颜色 set ray_interior_color, grey set ray_interior_color, grey,obj01 开关单双键模式 valence set valence,1 ...
as surface clip near,-10 ray 注解 为了获得想要的效果,多次尝试clip的数值。也可以通过滚动数据获得切面设置截面的颜色 set ray_interior_color, grey set ray_interior_color, grey,obj01 开关单双键模式 valence set valence,1 开启双键模式。 set valence,0 关闭双键模式。 示例打开PyMOL fetch BUH bg_cl...
更具体的操作可参考官方提供的Show as说明,此外,As命令等价为按键S(Show)->as。 通过clip命令可以对蛋白质进行切片,例如clip near,-5表示从离我们近的这端向前切5A,注意这个切片是连续的,即每次都基于当前值。通过help clip可以查看其详细信息,这里不赘诉。 通过set命令可以很方便地设置分子的颜色和样式,例如set...
pymol链之间作用力 pymol链之间作用力 打开软件，加载结构文件，找到需要分析的链。在PyMOL操作界面左侧对象列表里选中特定链，点击右键选择"showassurface"或"cartoon"模式，方便观察整体结构。按下键盘字母"A"调出动作菜单，输入"distance"命令进入距离测量模式，鼠标点击两个链上的原子，软件自动显示原子间距并生成虚线...
6、esidue i denti Fi er13.1abcl出来后,还可以调整它们的位置点一下左囱vicving,就变成了右图的editing,这时就可 以按住Ctrl键拖动label的位置了Mou.se Mode 3-Bu.tton Viewing:ButtonsLMRWheel& KeysRotaMoveMovZSlabShFt+ Box-BoxClipMovSCtrl+ /-PkAtPklMuS乙CtShSei eOrigClipMovZSnglClk+ /-CentMenu....
2使用这 例如当我们键入:Pymol hide lines Pymol show ribbon 我们将得到如下结果: Move front clipping plane inward Move back clipping plan包 outwardExpand wedgeMove wedg( inwardRight ClickMove front clippinqShrink wedgeoutward Move back clipping plan包 outward Expand wedge Move wedg( inward Right ...
6、CtSh Sele SnglCLk +/- DblClk MenuM R Wheel Move MovZ Slab -Box Clip MovS PkAt Pkl MuSZ Orig Clip MovZ Cent Menu-PkAtSelec七in号 ResiduesState 1/1 M <. > I,V F下载打开7cel的pdb文件后,在all小框下面会出现7cel小框,后面还跟着 几个按键ASHLC这几个按键后面会一点点介绍。先左键点...
MvSZCtShSeleOrigClipMovZ SnglClk.♦/-CentMenuDblClkMenu- PkAtSelectingResiduesStateC1/1J 0/sec II 最后一项“移动剪切平面”有点不容易理解,需要多试几次。配合下面的示意图你会发现Pymol的这 项设定其实很方便。 Movefrontclipping planeinward
ShFt+Box-BoxClipMovS Ctrl+/-PkAtPklMuS乙 CtShSeieOrigClipMovZ SnglClk+/-CentMenu. DblClkMenu — PkAt SelectingResidues > State1/1 MouseMode3-ButtonEditing ButtonsLMRWheel &KeysRotaMoveMovZSlab ShftRotOMovOMvOZMovS CtrlMovA PkTBMvSZ