命令 10 - 增加和减少结构的透明度 这是一个有趣的命令。为了增加和减少结构的透明度，我们可以使用命令set cartoon_transparency, 0.60，其中表示更不透明，越接近 1 越透明。看看我们的结构在降低透明度后看起来有多透明。现在，如果我们想让我们的结构恢复到之前的样子，我们可以在 PyMOL 命令框中键入set cartoon...
这是一个有趣的命令。为了增加和减少结构的透明度,我们可以使用命令set cartoon_transparency, 0.60,其中0表示更不透明,越接近 1 越透明。 看看我们的结构在降低透明度后看起来有多透明。现在,如果我们想让我们的结构恢复到之前的样子,我们可以在 PyMOL 命令框中键入set cartoon_transparency, 0 (因为 0 表示不透明...
修改cartoon透明度: set cartoon_transparency ,0.5 保存高质量图片: 先用ray渲染,再用png保存. PyMOL展示可视化结果: 氢键: 在配体中选择: Label相关: (1)字体大小 label字体的默认大小是14pt, 单位是pt: 命令:set label_size,20 菜单栏:setting -> label -> size (2)颜色: ...
点击S->as->cartoon观察该分子对象的不同形态,如图1所示。视频教程蛋白对象的简单平移、旋转、缩放首先将鼠标移动到2.1可视化窗口平移,按住鼠标中键不放,然后上下左右移动,进行体会,蛋白会随着鼠标而移动 旋转,按住鼠标左键不放,然后上下左右移动鼠标,蛋白会进行旋转 缩放,按住鼠标右键不放,然后上下移动,蛋白会进行...
效果如下: Setp7, 单独给cartoon设置颜色:set cartoon_color, yellow Setp8, 恢复默认颜色, set cartoon_color, default Setp9, 给特定对象设置颜色set cartoon_color, yellow, 4pl6 Setp10, 给特定对象设置透明度, set cartoon_transparency 0.4 4pl6...
2.4 细节调整 1)将cartoon 设置成透明的;点击菜单栏中的Setting->Transparency->cartoon->50%;Uni-layer; 点击菜单栏中的Setting->Transparency->Uni-layer 2)Sticks显示的残基,C,按元素并选择第一个选项 3)set label_color, green, 对象名#可以更改标签颜色但是好像改了也不好看发布...
🎨 Cartoon Transparency:从PyMOL 2.3开始,你可以设置Cartoon的透明度了!这允许你在保持Cartoon风格的同时,增加图片的层次感和细节。💡 小贴士:在设置时,记得备份你的原始文件,以防设置出错导致图片损坏哦。现在就去试试吧,让你的PyMOL图片更加出彩!🎉...
show surface transparency - 增加或减少结构的透明度 set cartoon_transparency, 0.60 #其中0表示更不透明，越接近 1 越透明 4 创建测量对象 distance - 用于测量距离 distance measure01, b/46/ce, b/53/cg dist – 用于测量氢键 dist hbond01, chain a, chain b, mode=2 angle - 用于测量角度 angle...
通过工具栏设置:在PyMOL的工具栏中,可以找到设置透明度的选项,通常位于“Setting”菜单下,可以选择对surface、sphere、cartoon、stick等不同类型的分子表示方式设置透明度。 通过命令行设置:使用set_transparency命令可以设置整个分子或特定选择的透明度。例如,将整个蛋白质的透明度设置为0.5(50%不透明): python set_trans...
这是一个有趣的命令。为了增加和减少结构的透明度,我们可以使用命令set cartoon_transparency, 0.60,其中0表示更不透明,越接近 1 越透明。 看看我们的结构在降低透明度后看起来有多透明。现在,如果我们想让我们的结构恢复到之前的样子,我们可以在 PyMOL 命令框中键入set cartoon_transparency, 0 (因为 0 表示不透明...