将处理好的PDB导入PyMoL,设置spectrum为b-factor,如下图所示:此时的蛋白质结构:使用脚本调整一下颜色的范围(这些颜色名称在Color栏中都可以找到)
using boost::spirit::qi::_1;expression = term [_val=_1]term = factor [_val=_1]>> *( ('*' >> factor [_val=_val*_1])| '(' >> expression [_val=_1] >> ')'| ('+' >> factor [_val=_1])| ('-' >> factor [_val=-_1])概述 PyMOL适用于创作高品质的小...
将处理好的PDB导入PyMoL,设置spectrum为b-factor,如下图所示: 根据b-factor设置颜色 此时的蛋白质结构: 使用脚本调整一下颜色的范围(这些颜色名称在Color栏中都可以找到) spectrum b, blue cyan yellow tv_orange orange tv_red red
由于本人的课题是研究蛋白热稳定性,筛到几个好的突变体,老板让分析一下,让看看突变体的B-factor,hydrogen bone,charge-charge,范德华力和野生态有什么区别,最后得出规律,由于对Pymol这个软件还是新手,看了一些教程,但是没有这方面的,不知道有没有师兄师姐做这方面,指导一下,这些参数在Pymol中怎么得到,另外,在Py...
想知道楼主这种B-factor分析图用pymol怎么做的呀?
另外,在Pymol中的label中B-factor,当选中一个氨基酸对其添加label中的B-factor时会出现好几个数,...