Pymol可以对两个结构使用命令 align 1, 2 进行比对,得出RMSD。和数学公式RMSD不同,其将两个结构进行对齐后计算rmsd,为了验证这一假设,先把某个分子做平移 translate [3,3,3],1 调整两个结构视角 zoom 重新进行rmsd计算 align 1,2 你会发现计算结果和之前一样,说明Pymol计算rmsd时候进行了对齐操作,而非原始...