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四、假阳性率(False Discovery Rate, FDR)在大规模蛋白质组学研究中,为了控制鉴定结果的质量,通常会设置一定的假阳性率阈值。FDR值越低,说明蛋白质鉴定结果的准确性越高。以上四个参数是解读GST pull-down质谱分析结果的关键,它们共同决定了结果的准确性和可信度。理解这些参数的含义和重要性,对于正确解读实验...
因此,要观察pulldown实验结果中的条带,需要对电泳分离后的凝胶进行染色并观察。一般来说,采用Coomassie Blue染色法或银染法都可以使条带更加清晰可见。条带的位置越靠近凝胶顶部,则表示分子量较大;条带的位置越靠近凝胶底部,则表示分子量较小。此外,条带的强度也可以反映出蛋白质与染色质之间相互作...
实验组GST-pull down第三列的实验结果可以看出KU-HIS,GST的条带中只检测到了GST,说明KU-HIS没有连接到亲和纯化柱上而被洗脱掉了。而在第四列的实验结果可以分别检测到GST与HIS 标签说明KU与TOP6发生了相互作用使得在条带中分别检测到了GST与HIS标签。
🔍 通过Pull down实验,我们可以验证已知或预测的直接蛋白质-蛋白质或蛋白质-DNA/RNA相互作用。实验结果通常通过凝胶电泳和免疫印迹等技术进行检测和分析。 📊 在解读Pull down实验结果时,我们需要注意以下几个方面: 1️⃣ 诱饵蛋白质与目标蛋白质的相互作用是否明确且可重复。 2️⃣ 实验结果是否与预期的...
之后是Pull down组,先看第一列,图中分别使用MBP抗体和GST抗体进行检测,可以看到使用MBP抗体检测时并...
pull down 实验的结果通常是通过蛋白质分析技术(如免疫印迹、质谱分析等)得到的。根据实验设计和目的,可以使用不同的方法来分析结果。以下是一些常见的分析方法: 免疫印迹(Western blotting):通过将捕获的蛋白质进行电泳分离,然后使用特异性抗体来检测目标蛋白质及其相互作用伴侣的存在与否。可以通过比较不同样品的带状图...
在这次实验中,通过GST pull down技术,可以有效地验证GST-Atrogin-1-wt和β-catenin之间的相互作用。具体来说,实验包括两部分,首先是通过考马斯亮蓝染色观察GST bead与GST蛋白或GST-Atrogin-1-wt的孵育效果,以及在孵育后的bead中拉取β-catenin。然后是免疫印迹技术,将相同胶上的蛋白通过转膜转移到...
当进行RNA pull-down实验时,可以根据不同的需求选择不同的下游检测方法。以下是几种常见的下游分析方法及其结果的解释: 1. 蛋白质鉴定 可以使用质谱分析等方法对拉取到的蛋白质进行鉴定,从而确定RNA与哪些蛋白质发生了相互作用。对于蛋白质鉴定结果,需要关注鉴定出的蛋 ...
GST pull down实验结果怎么看啊 这张图的主要目的是为了证明GST-Atrogin-1-wt(野生型)和β-catenin在体外的相互作用, 上图是考马斯亮蓝染色的图,看划线的解说,说明实验中是用GST bead与纯化的GST蛋白或GST-Atrogin-1-wt共同孵育,用孵育后的bead来拉裂解液中的β-catenin 下图免疫印迹的,也就是western blot的...