CID,即Compound ID,是PubChem数据库中用于唯一标识化合物的数字。每个CID对应一个特定的化学物质,包含了该物质的结构、名称、生物活性等信息。 为什么需要批量检索CID? 在进行化学研究或数据分析时,我们经常需要查询大量化合物的信息。手动一个个查找既耗时又低效。批量检索CID可以让我们快速获取需要的化合物数据,从而更...
CID，即Compound ID，是PubChem数据库中用于唯一标识化合物的数字。每个CID对应一个特定的化学物质，包含了该物质的结构、名称、生物活性等信息。为什么需要批量检索CID？在进行化学研究或数据分析时，我们经常需要查询大量化合物的信息。手动一个个查找既耗时又低效。批量检索CID可以让我们快速获取需要的化合...
Pubchem CID是NCBI: National Center for Biotechnology Information数据库的子库Pubchem 数据库对代谢物建立的编号。Pubchem目前收录了近一亿个Compound的全面信息(物理、化学、生物特性等),是最大的开源化合物库。 Pubchem CID的格式为单纯的数字,也就是顺序号。比如:D-Glucose的Pubchem CID为5793;L-Glucose的Pub...
Pubchem CID,即PubChem Compound ID,是PubChem数据库的化合物登录号,由纯数字组成,例如D-葡萄糖(D-Glucose)的Pubchem CID是5793。 1.2.5 CAS Registry Number CAS注册号是某种化合物唯一且明确的标识符,是美国化学学会CAS注册数据库的注册号。CAS注册号是数字标识符,最多由10个数字组成,用连字符分为三部分,其...
利用FTP客户端软件（例如FileZilla）与PubChem的FTP服务器建立连接。精心挑选所需的数据集，例如Compound、Substance或BioAssay，并进行下载。此方法特别适用于那些需要大量下载数据的科研项目，它极大地便利了数据的本地存储和离线分析。API接口 PubChem提供了丰富的API接口，允许用户通过编程方式访问和下载数据。API文档地址...
Retrieve compound information from pubchem CID
我需要从搜索结果的屏幕上获取“复合CID:”编号,但无法获取。我需要帮助。 driver = webdriver.Chrome() url = "https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/" driver.get(url) driver.maximize_window() searchInput = driver.find_element_by_xpath("/html/body/div[1]/div/div/main/div[1]/div/div[2]/div...
你可以通过PubChem的FTP站点或PubChem PUG REST API获取化合物的CID(Compound ID)列表。这里以使用REST API为例,展示如何根据化合物名称获取CID列表。 以下是一个Python代码示例,用于从PubChem获取化合物的CID列表: python import requests import pandas as pd # 需要检索的化合物英文名称列表 names = ["aspirin"...
pythonwith open('cids.txt') as f: cids =[line.strip() for line in f]for cid in cids: compound = pcp.Compound.from_cid(cid) print(compound.iupac_name, compound.molecular_weight)8.结论 使用PubChem REST API创建爬虫是一项非常有用的技能，可以帮助化学研究人员快速、高效地收集所需数...
表1和2列出了PM6几何结构优化数据，包括大量化合物和包含详细数据的文件名字，比如PubChem CID、分子量、InChI、异构体的SMILES以及分子式。比如，“MW less than 1000”列出了PubChem Compound库中分子量低于1000的分子数量；“charged molecules”列出了带电分子的数量和包含详细数据的文件名；“no results”列出了PM...