PubChem数据库包括 3个子数据库: PubChem BioAssay 库用于存储生化实验数据,实验数据主要来自高通量筛选实验和科技文献; PubChem Compound 库用于存储整理后的化合物化学结构信息; PubChem Substance 用于存储机构和个人上传的化合物原始数据 。 网址链接传送门 PubChempubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ 关于数据库如何正...
每个化学物质在 PubChem 中都有一个唯一的标识符,称为 "PubChem Compound ID"(PubChem 化合物编号)。 PubChem 化合物编号通常是一个由数字和字母组成的字符串,用于唯一标识数据库中的每个化学物质。这些编号可以用于在 PubChem 数据库中查找和检索特定的化学物质信息。 要获取某个具体化学物质的 PubChem 化合物...
表1和2列出了PM6几何结构优化数据，包括大量化合物和包含详细数据的文件名字，比如PubChem CID、分子量、InChI、异构体的SMILES以及分子式。比如，“MW less than 1000”列出了PubChem Compound库中分子量低于1000的分子数量；“charged molecules”列出了带电分子的数量和包含详细数据的文件名；“no results”列出了PM...
PubChem Compound (物质) --用于存储整理后的化合物化学结构信息; PubChem Substance (生物检测剂)--用于存储机构和个人上传的化合物原始数据。 PS:习惯使用PubChem Entrez的用户,在新的PubChem主页搜索时可以勾选指向Entrez的链接。 仔细看的话,PubChem还提供提供以下检索方式:物质名称、分子式、各类代码(如CAS登记...
利用FTP客户端软件（例如FileZilla）与PubChem的FTP服务器建立连接。精心挑选所需的数据集，例如Compound、Substance或BioAssay，并进行下载。此方法特别适用于那些需要大量下载数据的科研项目，它极大地便利了数据的本地存储和离线分析。API接口 PubChem提供了丰富的API接口，允许用户通过编程方式访问和下载数据。API文档地址...
1. PubChem BioAssay存储生化实验数据，主要源自高通量筛选实验与文献资料。2. PubChem Compound用于整合整理后的化合物化学结构信息。3. PubChem Substance接收来自机构与个人上传的原始化合物数据。在访问 PubChem 时，主界面提供主要功能分类：化合物（Compounds），物质（Substances）和生物检测（Bioassays）...
PubChem Compound(物质) --用于存储整理后的化合物化学结构信息; PubChem Substance(生物检测剂)--用于存储机构和个人上传的化合物原始数据。 PS:习惯使用PubChem Entrez的用户,在新的PubChem主页搜索时可以勾选指向Entrez的链接。 仔细看的话,PubChem还提供提供以下检索方式:物质名称、分子式、各类代码(如CAS登记号...
pythonwith open('cids.txt') as f: cids =[line.strip() for line in f]for cid in cids: compound = pcp.Compound.from_cid(cid) print(compound.iupac_name, compound.molecular_weight)8.结论 使用PubChem REST API创建爬虫是一项非常有用的技能，可以帮助化学研究人员快速、高效地收集所需数...
PubChem数据库包括 3个子数据库: PubChem BioAssay 库用于存储生化实验数据,实验数据主要来自高通量筛选实验和科技文献; PubChem Compound 库用于存储整理后的化合物化学结构信息; PubChem Substance 用于存储机构和个人上传的化合物原始数据。 访问PubChem网站点击打开链接 ...