PubChem数据库属于NCBI旗下，截至2024年6月，该数据库收录11800万种化合物结构信息（Compounds子库），31800万种用户上传的化合物数据（Substance子库），29500万种实验结果或文献支持的化合物生物活性数据（BioAssay子库），其中还包含4100万篇相关文献和5100万相关专利，以及113242个靶基因、247611个靶蛋白和241163条...
数据库属于NCBI旗下,截至2024年6月,该数据库收录11800万种化合物结构信息(Compounds子库),31800万种用户上传的化合物数据(Substance子库),29500万种实验结果或文献支持的化合物生物活性数据(BioAssay子库),其中还包含4100万篇相关文献和5100万相关专利,以及113242个靶基因、247611个靶蛋白和241163条通路信息,引用数据...
数据库属于NCBI旗下,截至2024年6月,该数据库收录11800万种化合物结构信息(Compounds子库),31800万种用户上传的化合物数据(Substance子库),29500万种实验结果或文献支持的化合物生物活性数据(BioAssay子库),其中还包含4100万篇相关文献和5100万相关专利,以及113242个靶基因、247611个靶蛋白和241163条通路信息,引用数据...
# 通过化合物名称查询CID compound = pcp.get_compounds(name, 'name')[0] results.append({"Chemical Name": name, "CID": compound.cid}) except IndexError: # 如果没有找到化合物,将CID设置为None results.append({"Chemical Name": name, "CID": None}) except Exception as e: # 记录其他错误 r...
PubChem数据库属于NCBI旗下,截至2024年6月,该数据库收录11800万种化合物结构信息(Compounds子库),31800万种用户上传的化合物数据(Substance子库),29500万种实验结果或文献支持的化合物生物活性数据(BioAssay子库),其中还包含4100万篇相关文献和5100万相关专利,以及113242个靶基因、247611个靶蛋白和241163条通路信息,引...
aspirin EGFR C9H8O4 57-27-2 C1=CC=C(C=C1)C=O InChI=1S/C3H6O/c1-3(2)4/h1-2H3 Use Entrez Compounds Substances BioAssays Draw Structure Upload ID List Browse Data Periodic Table See Data What is PubChem? PubChem is the world's largest collection of freely accessible chemical informati...
4.爬虫实现 我们将使用Python和PubChem REST API来创建我们的爬虫。我们需要安装pubchempy库，它是一个用于访问PubChem数据库的Python接口。pythonimport pubchempy as pcp#搜索化合物compounds = pcp.get_compounds('aspirin','name')#获取化合物属性for compound in compounds: print(compound.iupac_name) p...
PubChem数据库属于NCBI旗下,截至2024年6月,该数据库收录11800万种化合物结构信息(Compounds子库),31800万种用户上传的化合物数据(Substance子库),29500万种实验结果或文献支持的化合物生物活性数据(BioAssay子库),其中还包含4100万篇相关文献和5100万相关专利,以及113242个靶基因、247611个靶蛋白和241163条通路信息,引...
Compounds:当且仅当一个或多个物质记录包含可以标准化为相同化学结构的结构时,才会自动生成一个Compound record (CID)。例如,许多包含阿司匹林相同结构的化学药品供应商物质记录将被汇总到单个Compound record (CID)。Compound record成为可用于给定化学结构的所有PubChem信息的有用摘要。 BioAssays:数据源提交生物活性测试...
加入对比的分子数量少于原始PubChemQC数据集（包含3,981,230个分子），原因如下：第一，基础数据集不同，B3LYP/6-31G*方法用的是截止2014年7月PubChem compounds里的数据，而PM6用的是2016年8月的数据，两个数据集有很大的不同。虽然两个数据集共用了2,777,085个分子（CIDs），与2014年7月的版本相比，2016...