每个化学物质在 PubChem 中都有一个唯一的标识符,称为 "PubChem Compound ID"(PubChem 化合物编号)。 PubChem 化合物编号通常是一个由数字和字母组成的字符串,用于唯一标识数据库中的每个化学物质。这些编号可以用于在 PubChem 数据库中查找和检索特定的化学物质信息。 要获取某个具体化学物质的 PubChem 化合物
KEGG ID是京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)的KEGG标识符(KEGG Identifiler,KID)的一种,是给代谢物提供的编号,KEGG COMPOUND数据库收录了丰富的代谢物功能注释信息,尤其是代谢通路信息。代谢物的KEGG ID的格式为C[0-9]{5},C表示Compound,后面的5位数字为顺序号,例如卵磷脂(...
CID，即Compound ID，是PubChem数据库中用于唯一标识化合物的数字。每个CID对应一个特定的化学物质，包含了该物质的结构、名称、生物活性等信息。为什么需要批量检索CID？在进行化学研究或数据分析时，我们经常需要查询大量化合物的信息。手动一个个查找既耗时又低效。批量检索CID可以让我们快速获取需要的化合...
{ProteinGI, ProteinName, GeneID, GeneSymbol} <doseresponse> = doseresponse/sid For example, to access the molecular formula and InChI key for CID 2244, one would use a URL like: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/cid/2244/property/MolecularFormula,InChIKey/[] Output...
Compound record成为可用于给定化学结构的所有PubChem信息的有用摘要。 BioAssays:数据源提交生物活性测试结果以及描述substances(SID)的生物测定实验的相关注释。每个数据源的每个实验均分配有唯一的 BioAssay Identifier(AID)。BioAssay Identifier(AID)包括研究人员定义的生物活性的有/无活性测定,并附有解释。BioAssay ...
HMDB ID HMDB ID是HMDB:The Human Metabolome Database数据库对代谢物建立的编号,该数据包含了丰富的代谢物来源和分布信息(尤其是代谢物相关疾病信息)。目前HMDB数据库收录的Compound数量约为120000个。 HMDB ID的数据格式发生过一次调整:新版的HMDB ID格式为“HMDB[0-9]{7}”,“HMDB”+7位数的顺序号;旧版的HM...
首先是rest,pug,compound这三个就先不说了 然后就是cid,这次使用的是化合物id 然后11359451就是本次我们搜索的时候化合物的id咯 property就是说我们这次需要请求的是属性 MolecularFormula,MolecularWeight,InChI,InChIKey,CanonicalSMILES 。这些参数则是说明了我们请求的具体参数,分别是: ...
PubChem Compound，小分子化学物质结构; PubChem Substance，具生物活性之化学物质筛选数据;版主果然不同...
Compound Is Canonicalized:True XLogP3-AA:488.1350288 Monoisotopic Mass:488.1350288 Complexity:802 Rotatable Bond Count:8 Hydrogen Bond Donor Count:3 Hydrogen Bond Acceptor Count:8 Topological Polar Surface Area:107 Heavy Atom Count::34 Defined Atom Stereocenter Count:0 Undefined Atom Stereocenter Count...
你可以通过PubChem的FTP站点或PubChem PUG REST API获取化合物的CID(Compound ID)列表。这里以使用REST API为例,展示如何根据化合物名称获取CID列表。 以下是一个Python代码示例,用于从PubChem获取化合物的CID列表: python import requests import pandas as pd # 需要检索的化合物英文名称列表 names = ["aspirin"...