给药浓度条件;②采用标准、稳定的工业化步骤进行蛋白质组学样品前处理;③采用高端质谱仪器,搭配最佳的采集模式进行样本检测;④根据TPD药物项目特点及原始数据,设计特定的分析参数进行数据分析,绘制图像;⑤有效分析、解读数据结果,并结合不同TPD药物特点及相关的生物学实验结果等,为药物开发提供有效的证据、结论。
给药浓度条件;②采用标准、稳定的工业化步骤进行蛋白质组学样品前处理;③采用高端质谱仪器,搭配最佳的采集模式进行样本检测;④根据TPD药物项目特点及原始数据,设计特定的分析参数进行数据分析,绘制图像;⑤有效分析、解读数据结果,并结合不同TPD药物特点及相关的生物学实验结果等,为药物开发提供有效的证据、结论。
蛋白质组分析显示，先导化合物UM-STAT3-1218在细胞中仅降低STAT3蛋白的水平，对其他超过6700种蛋白质无影响。在激活了STAT3的白血病和淋巴瘤癌细胞系中，UM-STAT3-1218实现了低纳摩尔级别的IC50值。3 mg/kg的单次静脉注射剂量可以在异种移植肿瘤和原发组织中降低STAT3蛋白水平超过4天，而不降低其他任何STAT成员的水平。
(1)靶向BET家族的PROTACs:BET蛋白作为表观遗传的“阅读器”,能够与组蛋白和非组蛋白的乙酰化赖氨酸残基特异性地相互作用,以调节染色质动力学和基因转录。BET蛋白(包括BRD2、BRD3、BRD4和BRDT)包含两个溴结构域(BD)和一个外星结构域(ET)。 利用OTX015(图28)作为靶向BRD4的PROTAC 152。152在Namalwa和CA-46细胞...
在MV411 细胞系中,AK-1690 有效降解 STAT6 蛋白,DC50= 1 nM,Dmax> 95%(图 4A 和4D)。在PBMC 细胞中,AK-1690的DC50=80 nM,Dmax为>90%(图 4 B 和4 D)。 通过蛋白质组学在全蛋白质组水平上评估了 AK-1690 的降解选择性...
您可以登录http://www.deepkinase.com查看更多靶向蛋白降解分析相关信息 如上篇提到,TMT(Tandem Mass Tag)和DIA(Data Independent Acquisition)都是相对定量蛋白质组学分析技术,均可用于比较不同样品间蛋白含量相对差异。但是TMT技术建立在DDA(Data Dependent… ...
PROTAC技术平台..PROTAC分子的血浆蛋白结合,结果可用于基于血浆游离药物浓度的PK/PD分析。常用的三种方式包含平衡透析法,超滤法和超速离心法。由于PROTAC分子的非特异性吸附,更适用于超速离心法。通过优化离心的
然而，此研究目前也有一定的局限性，首先针对E3连接酶的研究主要集中在有限数量的E3连接酶上，如VHL/CRBN，缺少其他蛋白经验；其次由于目前缺乏大规模的单细胞蛋白质组学数据，无法更高分辨分析E3连接酶的活性，最后翻译后修饰(PTM)在调节E3连接酶的活性和丰度（丰度指的是E3连接酶的相对含量）方面也起着关键作用。P...
在细胞水平,这种持续抑制导致了对Burkitt's淋巴瘤细胞系优异的抗增殖和凋亡作用。在一个研究中,BRD4抑制剂JQ1与沙利度胺衍生物结合,由此产生的PROTAC,称为dBET1,能够在低纳摩尔浓度下诱导BRD4降解。对此PROTAC的蛋白质组学研究表明该化合物显着降低了c-myc、BR...
CBPD-409全水平降解选择性的蛋白质组学分析 为了在整体水平上研究CBPD-409相对于其他蛋白质的降解选择性，作者在VCaP细胞系中进行了整体蛋白质组学分析。尽管CBPD-409在DC50值为0.3nM的情况下在VCaP细胞中非常有效地诱导降解，并且能够在低至3nM的浓度下将CBP/p300降低≥95%，但用CBPD-409在100nm下处理细胞...