翻译 PFAM 释义 [计]= Programmed Frequency Amplitude Modulation,程控频率幅度调制
该数据库最新版本为31.0, 于2017年3月更新,包含16712个蛋白质家族信息。ftp地址如下 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/Pfam31.0/ 后缀为hmm的文件是由HMMER3构建的隐马可夫模型,可用于序列比对。
网址:Pfam is now hosted by InterPro InterPro:InterPro Pfam数据库是一个庞大的蛋白质家族集合,每个家族都由多个序列比对和隐马尔可夫模型(HMMs)表示,可以通过hmmsearch软件进行比对搜索。 InterPro网站可以进行在线预测 interproscan基因注释软件支持多个数据库的注释,其中Pfam数据库的注释 1.在线分析 选择上传蛋白序列...
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不过最近用了一段时间不同数据库,发现 pfam 的结果往往干净一点,简单来说,就是数据库的domain不多,但是还行,这个对于快速分析来说,还是实用。我测试了 Interpro 上 Pfam Search 的结果,认为还行。于是,干脆重新上线一个可视化功能,用于快速可视化对应结果,同时呢,配套这个推文。
PMAM 和 PFAM 微声弹也是活塞间接推动微声弹家族中的一员。9x93mm有两种类型的弹药--穿甲弹的PFAM“方阵”和PMAM空包弹“喉舌”,它被设计用来发射重量约为130克的30毫米BMYa-31榴弹,内部装药含燃烧剂,枪口速度约为110米/秒。BMYa-31榴弹的后部有突出的膛线,发射后自转稳定,另外还有训练用的惰性枪榴弹。该弹...
1.PfamScan本地安装:Tools文件夹(我下载的最新版) 1)解压,不需要修改开头指定perl pengzw@super-server:~$ mkdir ~/biosoft/pfampengzw@super-server:~$ cd ~/biosoft/pfampengzw@super-server:~/biosoft/pfam$ nohup wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/Pfam32.0/Pfam-A.hmm.gz &pe...
Large Diameters > 24″ NPS to match ASME B16.47 Series (B) Flanges Read More Paddle Blinds Flat Face Machined to Center (used with raised face or flat face flanges) Mill Finish (Not Machined) Female or Male Ring Type Joint Materials of Construction are Carbon Steel and Alloys ...
通过Pfam,研究人员可以查询蛋白质家族或蛋白质结构域的注释、结构以及多序列比对信息,从而更好地理解蛋白质的功能和演化。 在Pfam数据库中,每个蛋白质家族都由多个序列比对和隐马尔可夫模型(HMMs)所描述。这些家族是通过对大量的蛋白质序列进行比对和分析而得到的,它们代表了具有相似结构和功能的蛋白质群体。 Pfam数据...