pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。 qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted),是对p值进行了多重假设检验,能更好地控制假阳性率。校正后的p值不同的几种表现形式,都是基于BH的方法进行多重假设检验得到的。校正后的p值不同的展现形式是因为不同的分析软件...
pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值（qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted），是对p值进行了多重假设检验，能更好地控制假阳性率。校正后的p值不同的几种表现形式，都是基于BH的方法进行多重假设检验得到的。校正后的p值不同的展现形式是因为...
公式:p * (n/i), p是这一次检验的pvalue,n是检验的次数,i是排序后的位置ID(如最大的P值的i值肯定为n,第二大则是n-1,依次至最小为1)。 将计算出来的FDR值赋予给排序后的p值,如果某一个p值所对应的FDR值大于前一位p值(排序的前一位)所对应的FDR值,则放弃公式计算出来的FDR值,选用与它前一位相...
adjusted p-value(Padj):即经过统计学方法校正后的p-value,由于统计学上常用的校正方法包括“BH”、“FDR”等,因此我们常会看到筛选差异基因的阈值是FDR<0.05。 Fold Change:表示组间基因表达差异倍数,其绝对值越大说明某基因在两组之间的表达差异也越大。该值为正时,表示差异上调;该值为负时,表示差异下调。 坐...
pca3 <- svd(d.scale) # 解奇异值(singular-value ), pca3$d # 数据矩阵的奇异值(正交系数),与eigen()解的特征值不同。 svd(cor) # 才能得到与eigen()一样的特征值。 pca3$u # 左奇异值(正交系数(orthonormal coefficients)),每个主成分乘以对应奇异值就得到样本得分。
P-value:p值,是统计学检验变量,代表差异显著性,一般认为P < 0.05 为显著, P <0.01 为非常显著。其含义为:由抽样误差导致样本间差异的概率小于0.05 或0.01。 Padj:p.adjust。转录组测序的差异表达分析是对大量的基因表达值进行的独立统计假设检验,存在假阳性问题,因此引入Padj对显著性P值进行校正。Padj是对P-va...
Abdimajid OsmanWalter E. HitzlerAdam AmeurPatrick Provost
描述 Decode selected Base64 text using the context menu. Just select the encoded text and copy the decoded value. If the decoded text is a URL we go straight there instead of copying it. 无用户评价 排序方式 尚无人评价此扩展。抢先添加评价。
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