pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted),是对p值进行了多重假设检验,能更好地控制假阳性率。校正后的p值不同的几种表现形式,都是基于BH的方法进行多重假设检验得到的。校正后的p值不同的展现形式是因为...
对于有生物学重复的实验,由于DESeq已经进行了实验误差的控制,我们对差异基因筛选的标准一般为: qvalue < 0.05 和差异倍数|log2Fold Change|>1; 无生物学重复时,先采用TMM对read count数据进行标准化处理,再用DEGseq进行差异分析,筛选阈值为显著性qvalue < 0.05 和差异倍数|log2FoldChange|>1; 15 如果是差异...
pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。 qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted),是对p值进行了多重假设检验,能更好地控制假阳性率。校正后的p值不同的几种表现形式,都是基于BH的方法进行多重假设检验得到的。校正后的p值不同的展现形式是因为不同的分析软件...