百迈客自2019年引进PacBio SequelⅡ平台以来,在HiFi测序方面已经积累了大量的经验,在技术人员的不断优化下,HiFi文库单cell产出更是有了新的突破,下面跟大家分享一下最新的部分HiFi文库产出情况(表2)。在统计近1个月的HiFi cell中,我们单cell平均产出达416Gb。其中,单cell产出达400 Gb以上的占比达68%,同时,单cel...
基于PacBio HiFi测序技术的宏基因组测序,凭借长读长及Q30+的高测序准确度,可以轻松覆盖基因区间或基因特异性区域,大大降低了拼接错误,能快速精准的获得微生物信息,提高组装的完整度和注释的精确度。
这些出版物突出了PacBio测序的卓越能力。从优于传统方法的Onso系统到为进化研究设定新标准的HiFi测序,PacBio技术使研究人员每天都能做出新的突破性发现。了解如何加入下一个发现时代,并了解如何将PacBio数据纳入您的下一个项目: 与PacBio的科学家联系
从PacBio官网公布的测试结果看（如下表），相比于二代测序平台及三代ONT平台，PacBio HiFi Reads进行全基因组范围内的变异检测的准确性更高，对SNV精确度和检出率可达99.9%，对插入缺失的精确度和检出率可达99.4%。（详见In precisionFDA Challenge, PacBio HiFi Reads Outperform Both ShortReads and Noisy Long...
PacBio HiFi测序是一种先进的DNA测序技术,以下是对它的详细介绍: 一、技术原理 PacBio HiFi测序基于单分子实时测序(SMRT)平台,利用环状一致性序列(CCS)技术。在测序过程中,DNA分子被形成环状,通过聚合酶在ZMW(Zero-Mode Waveguide)孔中进行多次测序,生成高质量的共识序列,从而显著提高测序准确性。 二、技术特点 长...
PacBio HiFi测序技术仍然是基因组学专业人员在发现前沿工作的首选工具,使他们能够在生物学的不同领域寻求新的探索途径。 2024年6月的PacBio博客系列重点介绍了以下几篇科学论文。这些引人注目的研究成果突显了PacBio测序在单细胞RNA-seq分析方面的独特能力:揭示片段重复,以更好地了解人类疾病,进化和多样性,实现物种水...
而PacBio HiFi测序凭借无偏好性的特点,应该更多的用于发现原核生物的多样性并产生更可靠和更丰富的MAG(metagenome-assembled genomes)信息。 部分数据展示 贝加尔湖PacBio宏基因组研究 作者使用 PacBio CCS 对夏季收集的深水样本(1600米)进行长读长宏基因组(LAGs)测序,以补充以前在夏季和冬季在1250和1350米深的...
三代PacBio测序可分为: (1)HiFi(High fidelity reads)模式 -- 较新 (2)CLR(continuous long-read)模式 -- 旧 一、组装 本次组装主要使用 hifiasm,一款专门用于拼接 pacbio hifi 数据的软件 软件链接:https://github.com/chhylp123/hifiasm 组装脚本: ...
目前,PacBio的HiFi测序读长最高可达25000个碱基,而短读长测序技术通常在500个碱基以内。在实现读长超长的基础上,HiFi测序还能使准确性达到99.9%。综合读长和准确性指标,使得HiFi测序能够在基因组学中极具技术挑战的领域大放异彩。 同其它高通量测序类似,HiFi测序同样是边合成边测序,但HiFi测序无需进行PCR扩增,而是...
高光坪教授团队利用 PacBio SMRT 测序成功地对 rAAV 载体的基因组进行了全长单分子测序,并开创了 AAV-GPseq 测序,观察到了很多之前由于技术限制无法观察到的 rAAV 载体基因组的详细情况,例如对载体基因组异质性的全面评估、观察到质粒...