基于PacBio HiFi测序技术的宏基因组测序,凭借长读长及Q30+的高测序准确度,可以轻松覆盖基因区间或基因特异性区域,大大降低了拼接错误,能快速精准的获得微生物信息,提高组装的完整度和注释的精确度。
Here, we assembled a chromosome-level reference genome ofby integrating Pacbio HiFi long-reads, Illumina short-reads and Hi-C sequencing data. The size of this genome is 1004.34Mb with a contig N50 of 38.80Mb. Using Hi-C sequencing data, 99.59% of the assembled sequences were further ...
今天,人源Low-input Amplication-free HiFi Genome Sequencing(下文简称“1 μg HiFi”)产品正式公开亮相!1μg HiFi为诺禾致源自研的一款针对低起始量DNA人源样本的PB三代测序产品,无需PCR扩增,使用SMRTbell® prep kit 3.0建库试剂盒,通过优化建库方式,攻关克难,实现低DNA起始量建库,兼顾数据产出量、高质量(...
4.3 Hifimeth 在单分子水平上优于短 k-mer 模型。 4.4 高单分子水平准确度提高了 CpG 位点甲基化频率定量 4.5 用 hifimeth 解开复杂的单分子 CpG 甲基化模式 五、Discussion 六、Methods 6.1 参考基因组和注释 6.2 BS-seq 数据分析 6.6 基于纳米孔测序的甲基化配置 6.7 hifimeth 单分子甲基化调用模块的输入和...
PacBio HiFi测序技术仍然是基因组学专业人员在发现前沿工作的首选工具,使他们能够在生物学的不同领域寻求新的探索途径。 在这一期的PacBio博客系列中,重点介绍了2024年2月的科学论文。这些有趣的出版物突出了PacBio测序在揭示罕见疾病、癌症转录组学、农业基因组学等复杂性方面的力量。
PacBio HiFi测序技术使基因组学专家们能够在发现和探索各个生物领域的新领域方面处于领先地位。在这一期的PacBio博客重点介绍了2024年8月的科学论文。从SBB化学优势的文献证据,到看到HiFi如何在等位基因特异性表达分析方面表现出色,为人类进化研究提供明确的基线——这些论文展示了PacBio技术如何推动基因组研究的未来。
HiFi测序介绍及百迈客最新下机数据公布:一、HiFi测序介绍 定义:HiFi测序是PacBio于2019年推出的基于CCS模式产生的测序结果,兼具长读长和高精度。特点:HiFi reads具有1020kb的长读长和>99%的准确率。通过滚环测序和多次测序纠错,得到高准确度的测序结果。二、SMRTbell文库构建流程 结构:SMRTbell文库...
HiFi reads(High fidelity reads)是 Sequel II 三代测序平台推出的兼顾长读长和高准确度的测序序列,HiFi reads 具有 >99.9% (Q20)单分子 reads 准确度的准确率。一般采用 CCS(Circular Consensus Sequencing)模式测序。 hifi reads 原理图 在这种测序模式下,酶读长一般大于插入片段长度,因此酶会绕着模板进行滚环...
百迈客最新下机数据公布:平台:百迈客最近公布了一项PacBio SequelⅡ平台HiFi测序的最新成果。数据产出:单cell平均产出达416Gb,HiFi reads数据量高达32Gb。读长信息:酶读长平均超过70Kb,HiFi reads长达18Kb。服务优势:百迈客在基因组研究领域积累了丰富的经验,欢迎更多科研人员选择其HiFi测序服务。
同时,HiFi测序具备高准确性,通过循环一致性测序,HiFi测序能够生成>99.9%准确性的reads。 此外,HiFi测序无需PCR扩增,通过消除PCR扩增所带来的偏差,HiFi测序能够分析其它技术通常难以获取的基因组区域,如AT和GC富含区域、高度重复区域、长...