单细胞RNA测序异质性免疫微环境NK细胞在先天性免疫和适应性免疫中发挥关键作用,探究NK细胞的新亚型和异质性有助于了解NK细胞的不同功能.单细胞测序技术能够无偏倚地对单个细胞进行分析,目前单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)已广泛应用于多个领域,尤其是在免疫学方面.该文总结了利用scRNA-seq技术...
2020年5月20日,来自德国海德堡大学Department of Immunobiochemistry, Mannheim Institute for Innate Immunoscience的Adelheid Cerwenka教授课题组在Immunity(IF: 21.522)杂志上发表题为“Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NKC...
在2020年8月Nature Communications发表的题为“Single-cell RNA sequencing identifies shared differentiation paths of mouse thymic innate T cells”[3]文献中,研究人员就利用单细胞RNA测序技术确定了iNKT细胞、粘膜相关的不变T (MAIT)细胞和γδ T细胞通过共享的、分支分化而...
2020年6月16日,来自德国海德堡大学免疫生物化学系Mannheim固有免疫研究所的Adelheid Cerwenka课题组在Immunity发表文章“Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1α Unleashes NK Cell Activity”,该研究提供了来自小鼠肿瘤的单个NK细胞的转录图谱,...
Immune cell profiling of COVID-19 patients in the recovery stage by single-cell sequencing。 NK细胞(Natural Killer)数量(蓝色)。CD4细胞数量(绿色)。 先增后减。最后是减。 新冠病毒感染持续伤害的终极目标是免疫系统免疫能力/病毒对抗能力的大幅降低和丧失。
Koch Philipp-Sebastian., Sexl Veronika., Höfer Thomas., Cerwenka Adelheid.(2020). Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1α Unleashes NK Cell Activity....
可以看到上面的NK细胞细分,都是基于单个数据集,有很强烈的片面性,那么张泽民课题组的泛癌层面数据挖掘文章,2023年9月发表在CELL的《A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells》,就很好的解决了这个问题。在NK单细胞亚群里面主要是CD56和CD16,其实对应的基因名字是NCAM1和FCGR3A ,它们在单...
我们选择的数据已经发表的文章题目是“Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations”,2018年发表在nature communications上,数据存在GSE115469。 生信技能树jimmy 2020/12/11 1.9K0 多分组单细胞测序数据第一层次未整合和整合分析对B细胞细分的分群有何影响? datameta函...
Koch Philipp-Sebastian., Sexl Veronika., Höfer Thomas., Cerwenka Adelheid.(2020). Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1α Unleashes NK Cell Activity. Immunity, 52(6), 1075-1087.e8. doi:10.1016/j.immuni.2020.05.001...
2020年5月20日,来自德国海德堡大学Department of Immunobiochemistry, Mannheim Institute for Innate Immunoscience的Adelheid Cerwenka教授课题组在Immunity(IF: 21.522)杂志上发表题为“Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1a Unleashes NK Cel...