使用NCBI Reference Sequences (RefSeqs)查看目的基因序列信息 下载NCBI数据 NCBI 介绍 NCBI 是美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)的缩写,是一个提供生物医学和基因组学数据库及工具的国家级资源。 进入官网(ncbi.nlm.nih.gov/)后界面如下: 1、下拉列表,可指定查询的数据库。 2...
General protein information:提供该基因编码的蛋白名称。 界面最后NCBI Reference Sequences (RefSeqs)和Related Sequences两个版块均可用于查找目的序列。Related Sequences中多为研究人员自己提交的碱基和蛋白质序列,而NCBI Reference Sequences (RefSeqs)中是针对该基因的特定基因的NCBI参考序列,是最常用的序列集合。这...
）鼠标悬浮在转录本上，在转录本信息里可以看到“Status：MANE Select”。另外，转录本的选择一般有两种思路，一种是一般认为每个基因在“NCBI Reference Sequences(RefSeq)”条目里显示的转录本1是研究最多的，可以从转录本编号后边的“.几”来判断该转录本更新的次数，更新的次数越多代表该转录本研究的越多；另一...
General protein information:提供该基因编码的蛋白名称。 界面最后NCBI Reference Sequences (RefSeqs)和Related Sequences两个版块均可用于查找目的序列。Related Sequences中多为研究人员自己提交的碱基和蛋白质序列,而NCBI Reference Sequences (RefSeqs)中是针对该基因的特定基因的NCBI参考序列,是最常用的序列集合。这...
3.找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”从.1 .2 .3等等可以看到这个基因有不同的转录本，mRNA一般是NM开头，非编码RNA一般以NR开头，还有一种XM开头是生物信息预测的转录本。NP开头表示蛋白质，NC开头表示基因。点击下面三个“GenBank, FASTA, Sequence Viewer (Graphics)”就可以查看基因的信息和序列了。...
5、在“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”找到“mRNA and Protein(s)”,就可以找到基因序列信息,也可以看到基因有几个转录本信息。我们可以任意选择一个转录本,点击进去。 6、我这里点击“NM_000633.3”,会进入基因序列信息详情页,如图1,下拉页面,找到“CDS”字样点击后,会跳转至CDS区域的基因序列信息。CDS是编...
界面最后NCBI Reference Sequences (RefSeqs)和Related Sequences两个版块均可用于查找目的序列。Related Sequences中多为研究人员自己提交的碱基和蛋白质序列,而NCBI Reference Sequences (RefSeqs)中是针对该基因的特定基因的NCBI参考序列,是最常用的序列集合。这里小编重点介绍如何使用NCBI Reference Sequences (RefSeqs...
3.找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)” 从.1 .2 .3等等可以看到这个基因有不同的转录本,mRNA一般是NM开头,非编码RNA一般以NR开头,还有一种XM开头是生物信息预测的转录本。NP开头表示蛋白质,NC开头表示基因。 点击下面三个“GenBank,FASTA,Sequence Viewer (Graphics)”就可以查看基因的信息和序列了。
5.下拉到 NCBI Reference Sequences (RefSeq)区域,mRNA and Protein(s)下显示的就是该基因的转录本及其编码的蛋白: 6.一直下拉会发现该基因共有15个转录本 案例 以第一个转录本为例来告诉大家怎样查找转录本的核苷酸序列及其编码的蛋白质的氨基酸序列。
5.下拉到 NCBI Reference Sequences (RefSeq)区域,mRNA and Protein(s)下显示的就是该基因的转录本及其编码的蛋白: 6.一直下拉会发现该基因共有15个转录本 案例 以第一个转录本为例来告诉大家怎样查找转录本的核苷酸序列及其编码的蛋白质的氨基酸序列。