4、进入详情页后,核对一下基因名称和物种信息。此页面下拉至“NCBI Reference Sequences (RefSeq)” 5、在“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”找到“mRNA and Protein(s)”,就可以找到基因序列信息,也可以看到基因有几个转录本信息。我们可以任意选择一个转录本,点击进去。 6、我这里点击“NM_000633.3”,会进入...
您可以在页面上找到“Links & Tools”条目，点击“CCDS：CCDS11118.1”，进入相应的详细页面，找到“Nucleotide Sequence（1182 nt）即CDS序列”，找到“Translation（393 aa）即蛋白序列”。另外，在基因相关信息页面，下拉找到“NCBI Reference Sequences(RefSeq)”条目，在“mRNA and Protein(s)”里可以看到有不...
3.找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”从.1 .2 .3等等可以看到这个基因有不同的转录本，mRNA一般是NM开头，非编码RNA一般以NR开头，还有一种XM开头是生物信息预测的转录本。NP开头表示蛋白质，NC开头表示基因。点击下面三个“GenBank, FASTA, Sequence Viewer (Graphics)”就可以查看基因的信息和序列了。...
1、NCBI NCBI中有两个地方可以参考,一个是NCBI Reference Sequences (RefSeq)区域;一个是每个转录本的Nucleotide界面 有些基因NCBI明确会告知哪个主要转录本,比如 HIF1A这个基因,isoform1显示是“predominant transcript”,但实际上我们很少能在这个地方看到明确的...
找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein ”区可以让我们找到连续的编码 mRNA 序列和蛋白序列。在 mRNA and Protein下面有两个序列代码(中间划有一个箭头) ,这代表了 mRNA序列和蛋白序列。分别点击就可以得到相应的序列页面。点击后如图所示,mRNA 序列: ...
reference sequences (refseq) non-redundant sequence database transcripts proteinsThe National Center for Biotechnology Information (NCBI) Reference Sequence (RefSeq) database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/) provides a non-redundant collection of sequences representing genomic data, transcripts ...
3.找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)” 从.1 .2 .3等等可以看到这个基因有不同的转录本,mRNA一般是NM开头,非编码RNA一般以NR开头,还有一种XM开头是生物信息预测的转录本。NP开头表示蛋白质,NC开头表示基因。 点击下面三个“GenBank,FASTA,Sequence Viewer (Graphics)”就可以查看基因的信息和序列了。
不论是基因还是蛋白最需要关注的就是序列部分,序列就是在NCBIReference Sequences(RefSeq)条目下进行查看。 如下图,圈红的NC是基因,NP蛋白。点击框红部分,将显示的页面翻到最后就可以看到具体的序列信息了。 以蛋白为例,检索到的蛋白序列如下图。 02
NCBI中有两个地方可以参考,一个是NCBI Reference Sequences (RefSeq)区域;一个是每个转录本的Nucleotide界面。 有些基因NCBI明确会告知哪个主要转录本,比如 HIF1A这个基因,isoform1显示是“predominant transcript”,但实际上我们很少能在这个地方看到明确的提示。这个时候我们可以去Nucleotide界面: ...
找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein”区可以让我们找到连续的编码mRNA序列和蛋白序列。在mRNA and Protein下面有两个序列代码(中间划有一个箭头),这代表了mRNA序列和蛋白序列。分别点击就可以得到相应的序列页面。点击后如图所示,mRNA序列: ...