CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
1. Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 2. 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 3. 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中...
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。 出现如下界面,黄色部分即是本次要讲的工具。其中CD-search只能提交单条序列,Batch CD-Search可以上传多条序列。 2. 我们先以CD-Search为例,预测单条序列的结...
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
CD-Search与Conserved Domain Database(CDD)集成,为用户提供了一站式解决方案,能够快速、准确地在蛋白质序列中识别保守结构域。该工具通过分析提交的序列数据,自动识别其中的保守结构域,并以易于理解和解释的形式呈现结果。CD-Search的功能主要包括:数据库搜索:使用CDD中的结构域数据库对输入的蛋白质...
1.CDD⼊⼝:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该⼯具为NCBI提供的,NCBI主页选项⼝选择进⼊Conserved Domain然后点击Search。然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进⼊:粘贴基因...
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm./cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基因的GI...
在生信研究中,NCBI的CD(Conserved Domain)工具是挖掘蛋白质结构域信息的强大助手。这款工具设计简洁高效,能帮助研究者轻松揭示隐藏在蛋白质序列中的结构域秘密,从而深入理解蛋白质的功能和进化历程。结构域,作为蛋白质中的功能模块,是进化过程中保持相对稳定的区域。通过CD-Search对序列进行分析,研究者...
CD-Search是NCBI提供的一项服务,主要用于查找保守结构域。这个工具的核心功能包括: 1. Conserved Domain Database (CDD):CD-Search基于NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含了已知的结构域数据库。 2. 结构域识别:用户可以提交蛋白质序列,CD-Search将对序列进行分析,识别其中的保守结构域。