批量搜索结果如下，只展⽰部分结果，详细结果可点击download进⾏下载，或者点击Browse results 进⾏详细的可视化浏览；attachments-2018-07-K4e8FfiT5b5554032e57a.jpg 表格结果说明如下：Query输⼊的序列ID Hit type CD-Search results can include hit types that represent various confidence levels (specific ...
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
4. 选中“Gene”,在右边的搜索对话框中输入需要查找的基因名称。下图以 “DNA连接酶”为例,在对话框中输入 “DNA Ligase”,再点击最右边的Search。 5. 出现如下页面,找到“Search results”。红线指示的就是物种的名称 6. 仅仅搜索“DNA Ligase”会出现很多物种的DNA连接酶,我们在准备表达一个蛋白前,需要通过文...
3. 进入后有以下界面,如果是单条序列,直接进入CD-Search选项,如果要批量查询,则进入Batch-CD- Search。此处以单条序列为例进行介绍。 4. 进入CD-search后可直接粘贴核苷酸序列或者氨基酸序列到此框中。 5. 举个栗子: 输入我要查询的序列后就有了下面的结果,这样我就可以继续去查和这个基因有关的文献,以及该结构...
ncbi CD search结果解读由于基础知识薄弱,利用NCBI中的conserved domain search 工具分析一蛋白序列结果后,对显示的结果看不大明白。向各位求教,谢谢! 图中specific hits中为什么右边是锯齿形状呢,还有这图形颜色有什么含义吗?有锯齿是说明我的序列不完整嘛?如图一 有的结果在non-specific hits中也有匹配到的结果,这应...
以下是操作CD-Search的具体步骤: 1. 将你的蛋白质序列输入到CD-Search中; 2. 根据需要选择合适的搜索类型; 3. 分析结果后,你可以获取关于保守结构域的详细信息,如名称、数据库访问号、描述、区间以及与其他蛋白质的相似性等。 需要注意的是,虽然CD-Search可以处理单个序列,但它不支持批量处理读取的序列文件。如...
使用Batch CD-Search 结果: Query: 查询序列的标识符或名称。 Hit type: 表示匹配的保守结构域的类型, 可能的值包括 Domain, Family, Motif, 等,用于描述匹配的保守结构域的种类。 PSSM-ID: 保守结构域的位置特定得分矩阵 (PSSM) 的标识符。 From: 保守结构域在查询序列中的起始位置。
生信工具用得好,研究发文少烦恼。今天,我们将向大家介绍一个简单易用的工具——NCBI的CD-Search,帮助您轻松地从蛋白质序列中提取重要的信息,即保守结构域。 那么,什么是有保 用AI画美女,停都停不下来!御姐、甜妹、萝莉,你想要的这里都有,点击立即体验 →...
· CD-Search - The Conserved Domain Search Service (CD-Search) can be used to identify the conserved domains present in a protein sequence. · e-PCR 电子PCR - 将一个查询序列同已经定位的STSs比较,来发现查询序列的可能的图谱定位。E-PCR通过查找在的DNA序列中与定位标记的PCR引物非常吻合的子序列来...
利用NCBI的CD-search工具分析登录号ABD36508.1蛋白质,其无保守结构域。 A.正确 B.错误 点击查看答案进入小程序搜题 你可能喜欢 39.在程序中F只能表示进给速度。( ) A、正确 B、错误 点击查看答案进入小程序搜题 填料吸收塔开车时,应先通___、后通___。(填气,液。答案之间用一个空格隔开) 点击查看答案...