Max Score（最高分）和Total Score（总分）：表示检索结果中命中序列的最高分和总分。分数越高，表示命中序列与查询序列（也称做Query）的亲缘关系就越近，当最高分和总分不同时，表示命中序列有多个不同的片段与查询序列相匹配。最高分表示命中序列中得分最高的片段。总分表示所有片段得分的总和。Query ...
Word size(单词长度):默认为3,对BLASTP而言,大的单词长度会得到更精确的搜索结果。 Max matches in a query range(查询区域内的最大匹配数):有时在感兴趣区域内的匹配会被其他区域出现的频繁匹配所掩盖,这个选项允许抛弃数据库中的冗余匹配。 2.2 scoring parameters(得分参数) Matrix(矩阵):对于BLASTP,共有8个...
1score打分矩阵计算出来的值由搜索算法决定的值越大说明询问序列跟目标序列匹配程度越大2expect是输入序列被随机搜索出来的概率该值越小越好3identies是相似程度即输入序列和搜索到序列的匹配率4gaps就是空白即比对序列只有一条链上有碱基5strandplusminus即询问序列和数据库里面序列的互补链匹配blast可以用来进行序列比对...
至于说确定菌株是哪个，一般是Blast结果最上面那个，不知道你是处于什么研究目标，还有个分类学的网站http...
(3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Total score总体分值 (5)Query coverage覆盖率 (6)E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。 (7)Max ident——匹配一致性,即匹配上的碱基数...
blast页面有设置显示结果数目的选项，进入NCBI的blast界面（就是那个可以粘贴序列的界面），把网页拉到最...
How do you interpret NCBI BLAST results? How to Interpret BLAST Results Maximum Score is the highest alignment score (bit-score) between the query sequence and the database segments. ... Total Score is the sum of the alignment scores of all sequences from the same db. ...
根据目标基因和染色体位置筛选出包含引物序列的STS。点击链接查看预设的PCR片段长度和引物序列。步骤4：BLAST序列比对4. 在BLAST页面，选择Basic BLAST的nucleotide blast，输入序列进行比对。设置搜索集、精确度和参数后，点击比对，分析比对结果，注意理解评价指标如E value和Total score。
blast 结果描述区1.到其他数据库癿链接2.描述以表格癿形式呈现(以匹 配分值从大到小排序)(1)Accession 下程序比对癿序列名称,点击相应癿可 以进入更为详细癿map viewer (2)Descriptions 下是对所比对序列癿简单 描述接下来是5 个结果数值:(3)Max score 匹配分值,点击可进入第四部 ...
四.各序列blast的详细比对结果 数据库中不同序列比对的详细结果,每一个结果大体上包括3部分 1.所比对序列的名称、简单描述、长度。到其他数据库的链接。 2.比对结果的5个数值: (1)score打分矩阵计算出来的值,由搜索算法决定的,值越大说明询问序列跟目标序列匹配程度越大 (2)Expect是输入序列被随机搜索出来的...