Max Score(最高分)和Total Score(总分):表示检索结果中命中序列的最高分和总分。分数越高,表示命中序列与查询序列(也称做Query)的亲缘关系就越近,当最高分和总分不同时,表示命中序列有多个不同的片段与查询序列相匹配。最高分表示命中序列中得分最高的片段。总分表示所有片段得分的总和。Query ...
Word size(单词长度):默认为3,对BLASTP而言,大的单词长度会得到更精确的搜索结果。 Max matches in a query range(查询区域内的最大匹配数):有时在感兴趣区域内的匹配会被其他区域出现的频繁匹配所掩盖,这个选项允许抛弃数据库中的冗余匹配。 2.2 scoring parameters(得分参数) Matrix(矩阵):对于BLASTP,共有8个...
你点Alignments会展开,有助于你理解。至于说确定菌株是哪个,一般是Blast结果最上面那个,不知道你是处于...
(3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Total score总体分值 (5)Query coverage覆盖率 (6)E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。 (7)Max ident——匹配一致性,即匹配上的碱基数...
三.Descriptions——blast结果描述区 1.到其他数据库的链接 2.描述以表格的形式呈现(以匹配分值从大到小排序) (1)Accession下程序比对的序列名称,点击相应的可以进入更为详细的map viewer (2)Descriptions下是对所比对序列的简单描述 接下来是5个结果数值: (3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast...
打开BLAST网站: 填入核酸序列,选择比对数据库点击“blast”。人、小鼠有快速选项,若为其他物种,则点击“others”,“nr/nt”默认,物种输入指定的即可,下方给出三大物种指令: Norway rat (taxid:10116);house mouse (taxid:10090);Homo sapiens (taxid:9606) 结果界面,Max Score列数值除以2表示匹配的碱基数;完全...
帮顶,同问。[ 发自小木虫客户端 ]
描述以表格的形式呈现(以匹配分值从大到小排序) (1)Accession下程序比对的序列名称,点击相应的可以进入更为详细的map viewer (2)Descriptions下是对所比对序列的简单描述接下来是5个结果数值: (3)Max score匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Total score总体分值 (5)Query coverage覆盖...
blast 结果描述区1.到其他数据库癿链接2.描述以表格癿形式呈现(以匹 配分值从大到小排序)(1)Accession 下程序比对癿序列名称,点击相应癿可 以进入更为详细癿map viewer (2)Descriptions 下是对所比对序列癿简单 描述接下来是5 个结果数值:(3)Max score 匹配分值,点击可进入第四部 ...
描述以表格的形式呈现(以匹配分值从大到小排序) (1)Accession下程序比对的序列名称,点击相应的可以进入更为详细的mapviewer (2)Descriptions下是对所比对序列的简单描述 接下来是5个结果数值: (3)Maxscore匹配分值,点击可进入第四部分相应序列的blast的详细比对结果 (4)Totalscore总体分值 (5)Querycoverage覆盖率 ...