"How To Create Real-Time PCR Primers Using Primer-BLAST" from YouTube, 视频播放量 2554、弹幕量 0、点赞数 83、投硬币枚数 12、收藏人数 255、转发人数 18, 视频作者 无非一梦, 作者简介 下辈子不学医.,相关视频:PCR Primer Design【PCR引物设计】,设计PCR引物(How
需要批量处理、对数据库有特殊要求。涉及序列隐私等情况可以下载使用单机版。 一、BLAST界面 网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ 二、Blastp检索 1.基本检索 1.1 enter query sequence(输入查询序列) query subrange(序列范围):默认全部 1.2 choose search set (选择搜索数据库) ...
完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包有BLAST、FASTA等。 Blast主要程序 1.打开blast(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) 2.输入比对序列及参数 3. BLAST结果分析 一般评价一个blast结果的标准主要有三项,E值(Expect),一致性(Identities),缺失或插入(Gaps)。通用还会额外加上序列长度(...
1.基本概念相似性,同源性2.Blast介绍Blast资源和相关问题3.Blast的应用网络版,单机版4.深入了解Blast(改进程序,算法基础)5.其他的序列相似性搜索工具(fasta)3 生物序列的相似性 相似性(similarity):是指一种很直接的数量关系,比如部分相同或相似的百分比或其它一些合适的度量。比如说,A序列和B序列的相似性是...
三级结构的预测 基因芯片的数据分析 生物信息学常见的应用与软件 2 内容提要 1.基本概念 相似性,同源性 介绍 Blast资源和相关问题 的应用 网络版,单机版 4.深入了解Blast(改进程序,算法基础) 5.其他的序列相似性搜索工具(fasta) 3 生物序列的相似性 相似性(similarity): 是指一种很直接的数量关系,比如部 ...
BLASTP检索步骤1.1 输入查询序列,可自定义序列范围,默认全部。1.2 选择搜索数据库,一般选择nr/nt,可根据需要选择特定物种。1.3 筛选程序选择,如期望值、单词长度等参数进行设定。2. 算法参数: - 基本参数如最大显示条目、短查询序列影响期望值和范围长度。 - 得分参数包括矩阵选择(如...
NCBI使用教程3基因序列比对 NCBI(美国国立生物技术信息中心)的BLAST(局部相似性基本查询工具)是一个基于序列相似性的数据库搜索程序,它将DNA/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对,从而找到相似序列。 序列相似性比较是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与之相似的...
生物序列的相似性搜索-blast简介及其应用2005年3月
1.查找序列并打开Primer-BLAST ( 以人类GSR基因为例) 有两种方式,一种是按上期方法找到目的基因mRNA的页面,然后点击页面右侧工具栏内的Pick Primers 另一种方法是复制好目的序列后,在NCBI主页点击Blast,然后选择Primer-BLAST,把序列输入框内即可。 2.在Primer-BLAST中输入相关参数 ...
NCBI blast 官网使用教程,很基础很实用! BLAST Homepage and Selected Search Pages Introducing the BLAST homepage and form elements/functions of selected search pages http://blast.ncbi.nlm.nih.gov National Center for Biotechnology Information ? National Library of Medicine ? National Institutes of Health...