NBS-LRR(nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat)是植物中最大类抗病基因家族之一.番茄基因组测序完成为全基因组水平上分析NBS-LRR抗病基因家族提供了机遇.利用生物信息学方法对番茄NBS-LRR抗病基因家族成员数目进行鉴定,并对其染色体定位和系统发育关系进行了分析.随后,将番茄和马铃薯NBS-LRR抗病基因进行了比较...
番茄NBS_LRR抗病基因家族全基因组分析
摘要: NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类, 具有NBS (Nucleotide-binding site)和LRR (Leucine-leucine-repeat)结构域。甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序, 但尚未注释, 本研究对甘薯 基因组序列进行外显子预测, 得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列, 在此基础上进一步对NBS...
目前,不同植物中克隆超过 140 个抗病基因, 其中 80% 属于 NBS-LRR 类基因.NBS-LRR 抗病基 因家族已成为植物抗病研究的热点,已在拟南芥[7], 水稻[8],杨树[9],葡萄[10]和木薯[11]等植物中展开. 樟树(Cinnamomum camphora L. Presl.)是自然界中 较少受病原体侵害的优良抗性种质资源,但在生长 过程中亦...
NBS-LRR(nucleotide binding site plus leucine rich repeat)类抗病基因(R基因)是迄今为止从植物中克隆得到抗病基因数目最多的基因家族,也是植物基因组中最大的基因家族之一,于真核生物中广泛存在.研究表明,NBS-LRR基因在功能上负责植物对外来病原体的抗性,是近年来植物抗病分子育种研究的热点.然而,NBS-LRR基因的起源...
NBS-LRRR基因基因家族生物信息学NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类,具有NBS(Nucleotide-binding site)和LRR(Leucine-leucine-repeat)结构域.甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序,但尚未注释,本研究对甘薯基因组序列进行外显子预测,得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列,在此基础上...
目前,不同植物中克隆超过 140 个抗病基因, 其中 80% 属于 NBS-LRR 类基因.NBS-LRR 抗病基 因家族已成为植物抗病研究的热点,已在拟南芥[7], 水稻[8],杨树[9],葡萄[10]和木薯[11]等植物中展开. 樟树(Cinnamomum camphora L. Presl.)是自然界中 较少受病原体侵害的优良抗性种质资源,但在生长 过程中亦...
NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类, 具有NBS (Nucleotide-binding site)和LRR (Leucine-leucine-repeat)结构域.甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序, 但尚未注释, 本研究对甘薯基因组序列进行外显子预测, 得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列, 在此基础上进一步对NBS-LRR家族...
抗病基因家族成员,明确其类型,并进行序列特征,染色体定位,系统进化及生物胁迫下表达模式分析.【结果】从栽培番茄,潘那利番茄和醋栗番茄基因组中分别鉴定获得238,202和217个NBS-LRR类抗病基因家族成员,根据这些抗病基因编码的结构域差异,将其分为TNL(TIR-NBS-LRR),CNL(CC-NBS-LRR),RNL(RPW8-NBS-LRR),TN(TIRNBS...
并使用13个转录本数据,系统分析人参抗病基因在不同部位和不同生长年限的表达模式,发现人参抗病基因具有明显的功能分化和器官特异性.以锈腐菌(Cylindrocarpon destructans)侵染不同时间后转录本表达模式,对病原体特异识别抗病基因NBS-LRR家族及其它基因进行关联分析,解析人参防御过程中次生代谢活动与病原微生物防御反应的...