了比较基因组学分析.结果表明:番茄基因组共包括252个NBS-LRR抗病基因,分布于番茄12条染色体上;63.5%的基因成簇存在,大部分为串联重复;系统发育关系分析表明番茄CC-NBS-LRR(CNL)亚家族较其他亚家族扩展程度大;同线性分析发现番茄中共79个NBS-LRR抗病基因与马铃薯基因具有同源关系.结果将为番茄NBS-LRR抗病基因家族的...
番茄NBS_LRR抗病基因家族全基因组分析
1. NBS-LRR是最大的抗性基因家族之一 ; 2. 根据N端的Domains不同NBS-LRR分为两个亚族,含TIR的TIR-NBS-LRR(TNL)和含卷曲螺旋(CC)N端结构域的 CC-NBS-LRR(CNL)。 鉴定木薯NBS-LRR基因家族成员 利用从Pfam数据库下载的 raw NBS HMM 在木薯基因组数据中鉴定NBS基因,再用这些基因构建木薯特异的 HMM模型,然...
本文全面综述了国内外植物NBS-LRR抗病基因家族的研究进展,主要包括植物NBS-LRR抗病基因的克隆、结构、功能及其起源进化;进一步阐述了该基因家族在抗病基因同源序列克隆、分子标记开发、基因定位等方面的应用,同时对植物NBS-LRR抗病基因家族研究中存在的问题及未来研究方向进行了探讨。本文旨在为进一步开发和利用NBS-LRR抗病...
申哲源 1 ,李旭凯 2 ,韩渊怀 1 ,张宝俊 1(1. 山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801; 2. 山西农业大学 生命科学院,山西 太谷 030801)摘要: 对谷子 NBS-LRR 类家族成员进行鉴定,并对其染色体分布、基因结构、保守基序、系统进化及表达水平进行分析,为 NBS-LRR 类家族基因在谷子抗病分子育种中的应用奠定基础。
摘要: NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类, 具有NBS (Nucleotide-binding site)和LRR (Leucine-leucine-repeat)结构域。甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序, 但尚未注释, 本研究对甘薯 基因组序列进行外显子预测, 得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列, 在此基础上进一步对NBS...
目前,不同植物中克隆超过 140 个抗病基因, 其中 80% 属于 NBS-LRR 类基因.NBS-LRR 抗病基 因家族已成为植物抗病研究的热点,已在拟南芥[7], 水稻[8],杨树[9],葡萄[10]和木薯[11]等植物中展开. 樟树(Cinnamomum camphora L. Presl.)是自然界中 较少受病原体侵害的优良抗性种质资源,但在生长 过程中亦...
富含亮氨酸的重复序列(Leucine—richrepeat,LRR)类基 因是植物抗病基因家族中分布比较广泛的家族之一.. NBS这个区域经常广泛的被用于植物抗病基因的识 别和分类,在这个区域里面包含有一些非常保守的基 序【3J.根据系统发生学分析,在植物中以NBS—LRR结 构编码的这一类基因(以下简称NBS.LRR类基因)主 要被分成两大...
NBS-LRR(nucleotide binding site plus leucine rich repeat)类抗病基因(R基因)是迄今为止从植物中克隆得到抗病基因数目最多的基因家族,也是植物基因组中最大的基因家族之一,于真核生物中广泛存在.研究表明,NBS-LRR基因在功能上负责植物对外来病原体的抗性,是近年来植物抗病分子育种研究的热点.然而,NBS-LRR基因的起源...