因此,计算预测方法的使用越来越广泛,这些方法主要依赖于生物信息学的方法,通过构建模型,预测蛋白质序列中可能的N端糖基化位点。多种算法已经被用于预测N端糖基化位点,包括支持向量机(SVM)、随机森林、神经网络等。这些算法通过学习已知的N端糖基化位点和非糖基化位点的特征,构建预测模型,从而预测新的蛋白质序列中可...
预测N糖基化位点 N糖基化位点指发生N糖基化修饰的糖蛋白上肽链基酸残基与糖链共价结合的位点,N糖基化修饰具有位点特异性,其发生在-Asn-X-Ser/Thr或-Asn-X-Cys-(稀有)序列上,其中X为除脯氨酸以外的其他任何氨基酸。通过N糖基化位点特异性,可根据糖蛋白/糖肽氨基酸序列信息预测N糖基化位点信息。N糖基化...
N糖基化位点指发生N糖基化修饰的糖蛋白上肽链基酸残基与糖链共价结合的位点,N糖基化修饰具有位点特异性,其发生在-Asn-X-Ser/Thr或-Asn-X-Cys-(稀有)序列上,其中X为除脯氨酸以外的其他任何氨基酸。 通过N糖基化位点特异性,可根据糖蛋白/糖肽氨基酸序列信息预测N糖基化位点信息。N糖基化位点预测策略:经过N糖...
目的 预测人偏肺病毒(hMPV)融合蛋白N-糖摹化位点,构建N-糖基化修饰突变体.方法 NetNGlyc1.0 Server神经网络软件预测hMPV 4个亚型代表株F蛋白氨基酸序列的N-糖基化位点;根据预测结果针对性地没计突变引物,应用基因工程技术进行定点突变,从而获得特定位点去糖基化的F基因,包括单位点突变体、双位点... 查看全部>>...
结果hMPV4个亚型代表株F蛋白氨基酸序列从N端起第57、172、353位均存在可能性大于50%的N2糖基化位点。构建hMPVF蛋白7个不同的N2糖基化修饰突变体,并通过序列分析测定证实重组突变质粒构建成功。结论hMPVF蛋白的N2糖基化位点保守,不同亚型的代表株有相同的糖基化位点,利用定点突变技术成功构建了糖基化突变体重组...
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