蛋白磷酸化位点分析即鉴定蛋白质磷酸化发生在肽链的几号位氨基酸上以及发生在何种氨基酸上。可通过磷酸酶法、串联质谱测序法等方法进行检测,其思路大致为将样品蛋白进行酶解,得到肽段混合物,然后特异性识别并富集发生磷酸化的肽段,再对该肽段的氨基酸序列进行分析,找出发生磷酸化的位点。 蛋白糖基化修饰在真核生物中...
在黏蛋白型O-糖基化修饰中，与蛋白质连接的单糖残基是N-乙酰半乳糖胺（N acetylgalactosamine, GalNAc）；而在非黏蛋白型O-糖基化修饰中，与蛋白质连接的单糖残基可以是N-乙酰氨基葡萄糖（N-acetylglucosamine, GlcNAc）、岩藻糖（Fucose, Fuc）、甘露糖（Mannose, Man）、葡萄糖（Glucose, Glu）、木糖（Xylose,...
在网络上预测蛋白质序列中的糖基化位点主要依赖于使用生物信息学工具和数据库。预测糖基化位点的过程通常涉及以下几个步骤: 1. 获取蛋白质序列数据 你可以通过各种数据库(如UniProt)获取你感兴趣蛋白质的氨基酸序列。 2. 使用在线预测工具 在生物信息学领域有多种在线工具和数据库能够帮助你预测蛋白质的糖基化位点...
1.实验方法：质谱分析：质谱（MS）是确定蛋白质糖基化位点的黄金标准。通过对特定肽段的MS/MS分析，可以鉴定出糖基化的特定位点。免疫印迹：使用特定于糖基化位点的抗体进行检测。2.生物信息学预测：预测软件和数据库：如NetNGlyc（预测N-糖基化位点），NetOGlyc（预测O-糖基化位点），GlycoEP等。使用...
因此,计算预测方法的使用越来越广泛,这些方法主要依赖于生物信息学的方法,通过构建模型,预测蛋白质序列中可能的N端糖基化位点。多种算法已经被用于预测N端糖基化位点,包括支持向量机(SVM)、随机森林、神经网络等。这些算法通过学习已知的N端糖基化位点和非糖基化位点的特征,构建预测模型,从而预测新的蛋白质序列中...
生物药糖基化位点检测 生物制药N端测序 生物药氨基酸组成分析 单细胞分析 单细胞质谱流式技术 单细胞测序 检测平台 检测分析平台:高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱、NMR; 蛋白质组分析平台:Label-free、iTRAQ/TMT、SILAC、SWATH、MRM;蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析等; 代谢组分析平台:靶向代谢组学、...
本论文以蛋白质糖基化位点的预测为研究对象,针对目前蛋白质糖基化预测研究存在的不足,通过机器学习和数据挖掘的技术,分别提出针对人类蛋白质序列数据和人类蛋白质结构数据的糖基化位点预测方法GlycoMine和GlycoMine~(Struct),以及正例未标注学习算法PAnDE用于蛋白质糖基化位点的预测。主要成果如下:(1)人类蛋白质序列糖...
结合ICA和SVM进行蛋白质氧链糖基化位点的预测
基于核Fisher判别分析的蛋白质氧链糖基化位点的预测
目的了解天津地区人偏肺病毒 (hMPV)G蛋白特性,为深入研究(hMPV)奠定基础.方法采用RT-PCR方法扩增hMPV的G基因片段,测序后通过生物信息学软件分析核苷酸同源 性,绘制种... 李晓燕,陈锦英,孔梅,... - 《中国病原生物学杂志》 被引量: 0发表: 2010年 利用VSV△G~*G伪型病毒研究野生型与糖基化位点突变型F...