转录组测序是高通量测序中最常见也是使用非常广泛的一种测序手段,通过转录组测序可以得到样本在特定条件下转录水平的基因表达差异等信息。 一 转录组概念简述 转录组测序(RNA-seq,RNA sequencing)指针对某一特定时期、特定条件下转录的所有mRNA进行高通量测序。有真核转录组和原核转录组之分,由于m RNA结构的区别 其建...
参数含义:用java执行jar文件,开启8线程,使用单端模式,测序质量分数体系为phred33(现在的illumina测序都是),输入input_reads.fastq,输出output_reads.fastq。过滤参数包括:使用trimmomatic自带的TruSeq3-SE.fa作为测序接头序列进行剪切;对reads头尾均以碱基质量分数为3作为阈值进行剪切;进行滑窗质检,通过标准为4个碱基构成...
在这里,我们描述了一个简化的协议,称为VAX-seq,它使用长读纳米孔测序来测量mRNA疫苗和疗法的关键质量特征。与当前行业标准方法不同,VAX-seq是一个单一方法,能够测量关键的mRNA质量属性,包括序列身份、完整性、3'-聚(A)尾长度和DNA及RNA污染。为了支持VAX-seq,我们还开发了一个软件工具包,Mana,它提供详细和自动...
目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)的方法,其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 m6A甲基化测序技术优势 ...
5、预测结合的mRNA; 6、GO富集及KEGG分析。 技术参数: 1、样本类型:细胞、全血、组织等 2、推荐数据量:12M clean reads 3、测序策略:HiSeq PE150 RNA测序分析研究案例:从测序到投Nature旗下期刊文章3个月 研究人员培养并工程化改造了牛角膜内皮细胞,使其发生上皮-间质转化,并研究该过程中细胞内各通路的变化,...
mRNA-seq 测序与 分析采购项目网上竞价公告 福建省新卫招标代理有限公司现邀请合格的供应商对以下采购项目进行网 上竞价。 1 、项目编号: FJXW(JJ)20240 57 2 、项目名称: 福建农林大学 6 个烟草样 BS-seq 和 mRNA-seq 测序与分析采 购项目 3 、竞价采购标的名称、数量及技术参...
1.CITE-seq技术可以一次性获得单个细胞的mRNA和蛋白的表达量(目前来说对于蛋白的数量倒是没有明确的限制,但是一次性越多数量那么价格自然越高,所以目前来说常见的数量是100-200左右) 2.单细胞测序最大的优点就是可以实现计算单个细胞的表达量,避免了bulk-seq计算的平均表达量而导致的忽略小细胞亚群的结局,但是单细...
详细讲述了如果使用R语言进行WGCNA数据分析发布者 关注 R语言分析作图 全网讲课讲的最细的R语言Up主 课程概述 评论(0) 适合零基础学习,适合 常见问题 Q:课程在什么时间更新? A:课程更新频次以页面前端展示为准。购买成功后,课程更新将通过账号动态提示,方便及时观看。 Q:课程购买后有收看时间限制吗? A:购买后除...
6个烟草样BS-seq和mRNA-seq测序分析(第三次)手机查看收藏导出纠错标书代写 项目编号: WJ2024061 招标单位: 福建农林大学 发布时间: 2024-10-15 相关产品: 烟草样BS-seq和mRNA-seq测序分析 更新时间:2024-10-08 正文内容 福建农林大学供应商服务平台 - 福建农林大学6个烟草样BS-seq和mRNA-seq测序与分析采购项...