该测序方法的特点: MNase-seq 同样被广泛应用到了很多物种中。 结合其他方法,MNase-seq可以探测和核小体相关的调控因子,比如ChIP-seq。 单细胞的MNase-seq还没有被开发出来,因此依然需要大量的细胞作为样本。 MNase 的切割同样具有偏好性,AT含量更高的区域更容易被切割。
ATAC-Seq、ChIP-Seq、Dnase-Seq、MNase-Seq、FAIRE-Seq整体的分析思路一致,找到富集区域,对富集区域进行功能分析。 ChIP-Seq是揭示特定转录因子或蛋白复合物的结合区域,实际是研究DNA和蛋白质的相互作用,利用抗体将蛋白质和DNA一起富集,并对富集到的DNA进行测序。 DNase-Seq、ATAC-Seq、FAIRE-Seq都是用来研究开放染...