复制此段文字和链接,微信聊天窗口发送后打开【免费学习】孟德尔随机化法课程https://admin.sdlian.cn/l/ixWBMs7KWx附赠【最全实验protocol包】, 视频播放量 1745、弹幕量 0、点赞数 14、投硬币枚数 2、收藏人数 44、转发人数 8, 视频作者 酸菜教科研, 作者简介 酸菜,解螺
具体的输出结果如下图所示: 从图中我们不难看出,5种方法计算出来的结果是比较一致的,虽然MR Egger方法不显著,但是Inverse variance weighted (IVW)和Weighted median都是显著的,并且五个结果的效应值(b)都是正值,说明BMI的增加能导致糖尿病风险的升高。如果写到文章里的话,我们具体描述一下IVW的结果即可。 注意了...
孟德尔随机化,MR-Egger回归与其截距项 CodeMedicine 2172 0 09:47 孟德尔随机化法,MR可视化实操,异质性检验,多效性检验 酸菜教科研 777 0 05:36 孟德尔随机化,异质性Heterogeneity statistics CodeMedicine 1777 0 09:43 孟德尔随机化法,MR可视化实操,异质性检验,多效性检验 解螺旋官方频道 4698 0 ...
#通过b_exp的结果可以看出其系数并不显著。 fit <- mr_egger_regression(b_exp =data_final$beta.exposure, b_out = data_final$beta.outcome, se_exp = data_final$se.exposure,se_out = data_final$se.outcome) fit MR Egger的结果展示图。 #weighted medianand inverse variance weighted按照同样的方法...
其主要输出结果如下(注意mr_egger_regression是TwoSampleMR包里的函数): 代码语言:javascript 复制 # 直接回归(包含截距项,但没有flip的过程)summary(lm(beta.outcome~1+beta.exposure,weights=1/se.outcome^2,data=data)) 其输出结果如下: 通过上述比较我们不难发现,两个结果是有差异的,其中第一个是MR-Egger...
2.MR-Egger和加权中位数方法得到的结果与UK Biobank的主要线性分析相似(见下表)。 3.散点图未发现任何离群的遗传变异体(见下图)。在HUNT研究中,检测到1个离群值,但从分析中省略这一变异体并未实质性影响本文的结果。 敏感性分析的方法和结果的介绍就告一段落了。下一期,我们将继续以[BMJ. 2019]文献为例,...
首先,MR-Egger回归方程依赖于工具变量的选择。工具变量必须满足一定的条件,才能进行有效的因果推断。如果选择的工具变量不恰当,推断结果可能会出现偏差。 其次,MR-Egger回归方程假设存在一个共同的因果效应。然而,在实际研究中,可能存在多个不同的因果路径。这种假设的限制可能导致推断结果的不准确性。 此外,MR-Egger回归...
(1)在没有异质性和多效性的情况下,优先使用IVW的估计结果; (2)只有异质性,没有多效性时,优先使用Weighted Median方法的结果(也可以使用IVW的随机效应模型); (3)有多效性时,优先使用MR-Egger方法计算出的结果。 最后提醒一下,SNP数目多的时候统计效力足,但是异质性和多效性可能会比较大,如果去除部分SNP后...
结果: 结果表明,遗传预测的全身性炎症调节因子与ACLF有关。干细胞因子和碱性成纤维细胞生长因子水平的升高与急性肝功能衰竭发病风险的降低呈负相关(OR=0.486,95%CI=0.264~0.892,p=0.020;OR=0.323,95%CI=0.107~0.972,p=0.044)。MR-Egger截取未检测到干细胞因子和碱性成纤维细胞生长因子的潜在水平多效性(分别为p=...
对于长睡眠时间,MR-Egger 分析检测到深静脉血栓形成和心肌病结果的潜在多效性,但主要分析和敏感性分析的结果趋向于所有 CVD 的零假设 (Figure 2 and Supplementary material online, Table S12)。 该研究采用线性和非线性孟德尔随机设计,在大型数据库中探索了基因预测的睡眠时间与12种常见心血管疾病之间的因果关系。