目前gwas的公开结果很多,为了更加高效准确的进行MR分析,科学家们开发了MR-base数据库。该数据库收录了1600多个公开的GWAS结果以及基因,蛋白,代谢物,甲基化等不同水平的eQTL研究结果,同时开发了一个R包TwoSampleMR,并封装成了一个web app, 以方便科研人员,高效的利用这些公共数据集开展两样本的MR(简称2SM)分析, 对...
MR-base:高效准确的进行孟德尔随机化研究的网站 欢迎关注”生信修炼手册”! 通过孟德尔随机化研究,可以基于GWAS的结果来推断不同表型之间的因果关系, 比如使用的很广泛的两样本MR分析 对于暴露因素X和结局变量Y两个表型,以遗传变量G为工具变量,通过各自对应的gwas结果来推断二者的因果关系。 目前gwas的公开结果很多,...
The following error was encountered in trying to query the MR-Base server:Error in curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle): URL using bad/illegal format or missing URL: URL rejected: Malformed input to a URL function 怎么解决 03-17· 青海 回复喜欢 Steins gate 作者 没办法连...
· HBase:基于 Hadoop 的分布式数据库,用于实时读写大规模数据 分布式计算框架 · Spark:快速通用的大数据处理引擎,支持批处理、交互式查询和流处理 · Flink:用于实时流处理和批处理的开源流处理框架 · Storm:用于分布式实时计算和流处理的开源系统 数据处理与分析工具 · Kafka:用于高吞吐量的消息传输和实时流处理...
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swoole两种运行模式BASE和PROCESS的区别 Server的两种运行模式介绍 单线程模式(SWOOLE_BASE) 这种模式就是传统的异步非阻塞Server。与Nginx和Node.js等程序是完全一致的。 在时间循环中直接回调PHP的函数,而不是dispatch投递任务。如果回调函数中有阻塞操作会导致Server退化为同步模式。worker_num参数对与BASE模式仍然有效,...
数据持久化存储的体现形式是 Hfile,存放于 DataNode 中,被 ResionServer 以 region 的形式进行管理。 (4) 延迟较低,接入在线业务使用 面对大量的企业数据,HBase 可以直线单表大量数据的存储,同时提供了高效的数据访问速度。 2.HBase与Hive集成使用 注意:HBase 与 Hive 的集成在版本中兼容问题。
介绍一款免费的在线孟德尔分析的APP,不需要任何代码,可以完整地做出孟德尔分析的所有结果和图,非常简单 网址在这里 有时候需要科学上网 http://app.mrbase.org/里面嵌套的是TWO-sample MR的R包,可以实现two-sa…
1.下载seata-server,修改server配置 2.client端(你自己的项目),引入配置文件,修改配置文件(注意不要遗漏,可参考下方几个关键步骤) 3.数据源代理设置 4.创建数据库表 5.启动注册中心,启动server,启动client 关于调用成环和seata-server HA,见最后部分
Export导出工具与CopyTable一样是依赖hbase的scan读取数据,并且采用的ImportFormat与CopyTable一样是TableInputFormat类,从该类的getSplits()方法可以看出MR的map数与hbase表的region数相同。 采用hadoop dfs -get命令将HDFS文件获取到本地 采用zip -r命令将本地文件压缩成.zip形式 ...