主角:miRNA &单核苷酸多态性(SNP) miRNA本身长度才21个核酸左右,一个核酸发生变化,A变成G,T变成C,很有可能会影响它与靶基因的结合。那么如何对这一现象进行研究呢? 参考的这篇文章是2019年发表在《OncoTargets and Therapy》上的,影响因子3.046分。 从标题我们就可以看到这篇论文的主要内容是miRNA-499的参考SNP(...
首先看第一个,SNP。 点击进去后会看到如下界面,有两点解释一下: SNP GMAF表示SNP Global Minor Allele Frequency(全局次要等位基因频率),就是SNP变异型发生的频率; “SNP inGWASLD Region”这个选项表示SNP是否发生在SNP连锁不平衡区域(Linkage disequilibrium Region)。 下面的表格中,“Gain”表示发生这个SNP变异使得...
研究miRNA发生的SNP需要先找到miRNA，然后找到与其相关的SNP位点，并分析这些SNP位点对miRNA功能和与之相关...
MirSNP数据库就是一个存储了miRNA相关SNP位点的数据库,网址如下 http://bioinfo.bjmu.edu.cn/mirsnp/search/ 该数据库中包含两种miRNA相关的SNP位点,一种是位于pre-miRNA的gene上的SNP位点,这些SNP位点直接对miRNA的生成产生影响,分析过程示意如下 直接根据miRNA前体基因的染色体位置进行查找,筛选出位于该区域的SNP位...
今天给大家介绍的是另外一个miRNA SNP与疾病相关的数据库,哈尔滨医科大学李霞教授组出品的MSDD(miRNA SNP Disease Database),网址是http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/msdd/home.jsp。 相关文章发表于2017年发表在Nucleic Acids Research。与之前不同的是,MSDD是经过人工整理的,从2000多篇论文里,收集到了涵盖182个...
snp碱基可能影响靶点识别，导致结合的变化，可以通过计算能量值预测也可以实验构建点突变的载体，检测靶mrna...
首先,他们发现了一个miRNA的碱基突变与乳腺癌的病人生存预后是相关的,OR <1,说明miRNA的SNP是个保护因素,而位于miRNA上游CpG区域的高甲基化,也就是说当这个miRNA低表达时是个保护因素,毕竟高甲基化会降低表达嘛。 因此,合理推测这个miRNA有可能是个搞事情的oncogenic role。这里吐槽一下,研究人员在table的下面表明研...
emmmmmm，。。试图回忆一下尘封的知识，mirna和mrna的结合是一种不完全匹配，而seed区几乎是完全互补的，是识别靶点的核心区域。snp碱基可能影响靶点识别，导致结合的变化，可以通过计算能量值预测也可以实验构建点突变的载体，检测靶mrna表达量 MicroRNAs
研究发现,miRNA单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与多种自身免疫性疾病存在关联。鲁楠等对miRNA单核苷酸多态性与CSU的风险关联进行了分析。 微RNA单核苷酸多态性与慢性自发性荨麻疹发病风险的关联分析 鲁楠 谭兴友 刘香 牛李莉 姚树兰 作者单位:...
单核苷酸多态性 (SNP) 或拷贝数变异 (CNV) 是群体内常见的 DNA 序列变异,在非编码区更频繁地发生并导致人类疾病易感性。使用病例对照研究,已经报道了与精神分裂症相关的 miRNA 基因的几个 SNP。在斯堪的纳维亚(丹麦和挪威)样本中,miR-206 中的 SNP rs17578796 与精神分裂症显着相关。位于 pre-mir-30e 的变...