“Variation in miRNA”部分则介绍了在miRNA种子区域的SNP数目,成熟miRNA的SNP数目,在种子区域中与疾病相关的SNP数目(DRV)以及在成熟miRNA中,与疾病相关的SNP数目。 然后也展示了hsa-miR-10b-5p在各种肿瘤中的表达量,以及在CCLE和NCI60细胞系数据库中,药物敏感性与miRNA表达量的相关性,并显示了最为显著地几个药物。
我们以detail为例,来看看,这里面包含了miRNA的序列和结构信息,等位基因信息、SNP序列、靶基因信息、SNP位置、相关的疾病、检验的方法以及检测的内容(组织or细胞系),其中重点解释一下里面的Dysfunction pattern,这个的意思是SNP对靶基因表达的影响,下调或上调。 如果大家在miRNA SNP V3里找到了一些有意思的SNP,想看看有...
miRNASNP-v3 provides a one-stop resource for miRNA-related SNVs research with the following functions: (i) explore associations between miRNA-related SNPs/DRVs and diseases; (ii) browse the effects of SNPs/DRVs on miRNA-target binding; (iii) functional enrichment analysis of miRNA target gain/...