有的miRNA前体两个臂分别产生一条有功能的成熟miRNA，他们分别靶向不同的位点。这时候就要来进行区分了，一般以“-5p”和“-3p”分别命名，如hsa-miR-296-5p和hsa-miR-296-3p，分别表明从hsa-mir-296前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号，而表达水平较低的miRNA后面加上*...
例如，hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p分别表示从hsa-mir-21前体的两个不同臂加工而成的成熟miRNA。发夹结构的miRNA前体转录本被称为“mir”，编号以“MI”开始。例如，人的miRNA 21的前体ID为hsa-mir-21，Accession为MI0000077。针对这一问题，有两个解决途径。首先，如果之前的文献提供了特定序列或...
看到发表在19 July 2019的文章Strand-specific miR-28-3p and miR-28-5p have differential effects on nasopharyngeal cancer cells proliferation, apoptosis, migration and invasion,全文提供实验验证了miR-28-3p and miR-28-5p的生物学功能不一样。 但是我们作为数据分析人员,很难有这么复杂的背景知识,有时候仅仅...
位于基因组不同部位但产生同样的mature miRNA的pre-miRNA在序号后添加短线和阿拉伯数字以示区别,如hsa-mir-7-1, hsa-mir-7-2, hsa-mir-7-3。 有些pre-miRNA可以产生两个mature miRNA。对应pre-miRNA茎环结构5‘和3‘序列的mature miRNA分别加后缀-5p和-3p以示区分,如rno-miR-325-5p和rno-miR-325-3p。
成对miRNA 3p/5p的read比值分析中发现了8个前体来源的miRNA的3p/5p比值在不同组织中出现了统计学差异。 结论miRNA的3p和5p的总reads的比值及多个miRNA的3p、5p reads的比值在疾病不同阶段具有显著的变化,该结果提示miRNA在编辑成熟过程中的3p和5p臂的异常剪切可能与结直肠癌的发生发展密切相关。 关键词: 结直...
如 asu-miR-100b-5p 和 asu-miR-100b-3p,表明这两条 microRNA 分别从 asu-mir-100b 前体的 5’端臂和 3’端臂加工而来的。 少部分例外是在确定这一命名体系之前发现的 microRNA,则保留原来名字,如 cel-let-7。 植物microRNA 命名与前面所说的动物 microRNA 命名方式略有不同...
刚刚准备做miRNA， 设计引物的时候发现序列有3p和5p之分。该用哪个啊？师门里只有我做，求大神给解答一...
[摘要]Pre-血RNA经Dicer酶剪切产生2个产物,分别是miRNA一3p和miRNA一5p,以往的研究多数都是以单一的IIliRNA_3p或者111iRNA一5p为主,而miRNA一3p/5p成对调控肿瘤的发生发展却少有报道。本文就近年来miRNA.3p/5p与肿瘤的研究进展做一综述。[关键词] miRNA一3p;miRNA一5p;肿瘤;作用机制MiRNA-3p/5p in tumor ...
一般会有has-mir-21-3p和has-mir-21-5p，可是文献中一般只会说has-mir-21，这样的话文献中不提是...