miRNA的5p和3p是指从miRNA前体的不同臂加工而成的成熟miRNA。具体区别如下:来源位置:miRNA前体具有发夹结构,5p和3p分别表示从这一前体的5’端臂和3’端臂加工而成的成熟miRNA。例如,hsamiR215p和hsamiR213p分别是从hsamir21前体的两个不同臂加工而来的。命名规则:在命
如hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p,分别表明从hsa-mir-21前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号,而表达水平较低的miRNA后面加上*号,如hsa-miR-21*,有时带“*”的miRNA就根本不出现。 而发夹状结构的miRNA前体转录本以“mir”命名,其编号以“MI”编号,如人的miRNA 21...
miRNA的产生源于约70个碱基组成的单链RNA前体(pre-miRNA),通过Dicer酶的加工,形成长约20至24nt的成熟miRNA。这一过程中,有的pre-miRNA前体可能产生两条功能性的成熟miRNA,分别从5'端和3'端臂产生,分别标记为“-5p”和“-3p”。例如,hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p分别表示从hsa-mir-21...
学习连载:miRNA预后模型文章(COX模型验证microRNA区分3p和5p) “笙笙,你为什么总骗自己呢?”张千闭上眼睛,努力让自己平静。 林笙笑着笑着,这抹笑容里藏着半分苦涩:“许问啊……他说过会永远爱我的。” 在她的记忆里,许问好像从来都是温和的笑,他从来不发脾气,或许是因为家教的原因。 除了初三那年,林笙被人说...
看到发表在19 July 2019的文章Strand-specific miR-28-3p and miR-28-5p have differential effects on nasopharyngeal cancer cells proliferation, apoptosis, migration and invasion,全文提供实验验证了miR-28-3p and miR-28-5p的生物学功能不一样。 但是我们作为数据分析人员,很难有这么复杂的背景知识,有时候仅仅...
3. hsa-miR-19b-1后面添加的阿拉伯数字是指:一些位于基因组不同部位的DNA序列能够转录加工产生同样的成熟体序列的RNA,为了对其进行区别,在后面加上不同的阿拉伯数字。4. hsa-miR-19b-1-5p一些pre-miRNA可以产生两个mature RNA,在对应pre-miRNA茎环结构5’和3’序列的...
位于基因组不同部位但产生同样的mature miRNA的pre-miRNA在序号后添加短线和阿拉伯数字以示区别,如hsa-mir-7-1, hsa-mir-7-2, hsa-mir-7-3。 有些pre-miRNA可以产生两个mature miRNA。对应pre-miRNA茎环结构5‘和3‘序列的mature miRNA分别加后缀-5p和-3p以示区分,如rno-miR-325-5p和rno-miR-325-3p。
如 asu-miR-100b-5p 和 asu-miR-100b-3p,表明这两条 microRNA 分别从 asu-mir-100b 前体的 5’端臂和 3’端臂加工而来的。 少部分例外是在确定这一命名体系之前发现的 microRNA,则保留原来名字,如 cel-let-7。 植物microRNA 命名与前面所说的动物 microRNA 命名方式略有不同...
MiRNA-3p5p在肿瘤中的研究进展 张凌宇;陈昌杰;杨清玲 【摘要】Pre-miRNA经Dicer酶剪切产生2个产物,分别是miRNA-3p和miRNA-5p,以往的研究多数都是以单一的miRNA-3p或者miRNA-5p为主,而miRNA-3p/5p成对调控肿瘤的发生发展却少有报道.本文就近年来miRNA-3p/5p与肿瘤的研究进展做一综述. 【期刊名称】《分子诊断与...