(b) MeRIP-seq reads沿分类转录本的分布。 (c) 通过homer鉴定的RNA motif在目标m⁶A peaks区域中富集。 (d) 与5′UTR、起始密码子、CDS、终止密码子和3′UTR重叠的冷富集、对照富集和共有m⁶A peaks的百分比分布。 (e) 转...
使用meRIP-seq、RIP-seq和LACE-seq数据进行HOMER motif分析检测到的IGF2BP3结合位点和m6A motif的顶部共有序列。 饼图显示含有m6A peaks的IGF2BP3高置信度靶基因的数量和百分比。 RIP-seq、LACE-seq和meRIP-seq中各种RNA类型百分比。 Metagene分析显示IGF2BP3结合位点和m6A修饰在mRNA转录组中的富集情况。 不同基...
主流的有HOMER和MEME两款软件,我暂时学艺不精,再多说就是误人子弟了,大家自行搜索教程,比如下面这个: MeRIP-seq 数据分析之 homer 富集 motifmp.weixin.qq.com/s/DuGMbD33ldD2RriLCS6H8g 其他好的资源推荐(推荐每个都点进去看看) MeRIP/ChIP-seq分析流程ming-lian.github.io/2019/02/17/MeRIP-seq...
(a) 冷处理样品和对照处理样品的生物学重复进行重叠获得的高置信度m6A peaks分析鉴定出5829个对照富集(冷缺失)peaks、1318个冷富集m6A peaks和11个 943个共有peaks(未改变)。 (b) MeRIP-seq reads沿分类转录本的分布。 (c) 通过homer鉴定的RNA motif在目标m6A peaks区域中富集。 (d) 与5′UTR、起始密码子、...
(b) MeRIP-seq reads沿分类转录本的分布。 (c) 通过homer鉴定的RNA motif在目标m6A peaks区域中富集。 (d) 与5′UTR、起始密码子、CDS、终止密码子和3′UTR重叠的冷富集、对照富集和共有m6A peaks的百分比分布。 (e) 转录本的冷富集、对照富集和共有m6A peaks起始和终止密码子周围区域甲基化的核苷酸水平。每...
(a) 冷处理样品和对照处理样品的生物学重复进行重叠获得的高置信度m6A peaks分析鉴定出5829个对照富集(冷缺失)peaks、1318个冷富集m6A peaks和11个 943个共有peaks(未改变)。 (b) MeRIP-seq reads沿分类转录本的分布。 (c) 通过homer鉴定的RNA motif在目标m6A peaks区域中富集。
(b) MeRIP-seq reads沿分类转录本的分布。 (c) 通过homer鉴定的RNA motif在目标m6A peaks区域中富集。 (d) 与5′UTR、起始密码子、CDS、终止密码子和3′UTR重叠的冷富集、对照富集和共有m6A peaks的百分比分布。 (e) 转录本的冷富集、对照富集和共有m6A peaks起始和终止密码子周围区域甲基化的核苷酸水平。每...
(B) 使用meRIP-seq、RIP-seq和LACE-seq数据进行HOMER motif分析检测到的IGF2BP3结合位点和m6A motif的顶部共有序列。 (C) 饼图显示含有m6A peaks的IGF2BP3高置信度靶基因的数量和百分比。 (D) RIP-seq、LACE-seq和meRIP-seq中各种RNA类型百分比。
(B) 使用meRIP-seq、RIP-seq和LACE-seq数据进行HOMER motif分析检测到的IGF2BP3结合位点和m6A motif的顶部共有序列。 (C) 饼图显示含有m6A peaks的IGF2BP3高置信度靶基因的数量和百分比。 (D) RIP-seq、LACE-seq和meRIP-seq中各种RNA类型百分比。 (E) Metagene分析显示IGF2BP3结合位点和m6A修饰在mRNA转录...
使用meRIP-seq、RIP-seq和LACE-seq数据进行HOMER motif分析检测到的IGF2BP3结合位点和m6A motif的顶部共有序列。 饼图显示含有m6A peaks的IGF2BP3高置信度靶基因的数量和百分比。 RIP-seq、LACE-seq和meRIP-seq中各种RNA类型百分比。 Metagene分析显示IGF2BP3结合位点和m6A修饰在mRNA转录组中的富集情况。