madsbox基因家族保守结构域 MADS box基因家族是一类转录因子,它们在植物的发育过程中起着关键作用。这些基因编码的蛋白质包含一个保守的结构域,称为MADS盒(MCM1,AGAMOUS,DEFICIENS和SRF)。这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达...
MADS-box基因家族在植物、动物和真菌中广泛存在。MADS-box转录因子具有高度保守的MADS结构域,由56-58个氨基酸组成。根据蛋白质结构,MADS-box转录因子可分为两类,即类型I和类型II。类型I蛋白仅含有MADS结构域,并可进一步分为三个亚类,即Mα、Mβ和Mγ。类型II基因包括动物和真菌中的肌球细胞增强因子2(MEF2)-类...
MADS-box通常有两个保守的结构域:MADS和K结构域(其在pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486),作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,共鉴定出201个M-I-K-C家族成员。 进化树表明家族成员可分成15个亚类,构树时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-box家族基因(下图黑色基因)。 比较基因组分析...
MADS-box基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物花器官分化、开花时间调节、以及果实发育等方面起到重要的调控作用[9];其通常分为I型和II型,其中,II型有4个保守结构域:M-domain(MADS-domain)、I-domain(intervening domain)、K-domain(keratin-like domain)和C-domain(C-terminal domain)[10]。
MADS-box基因在N-末端含有一个高度保守的区域,由58~60个氨基酸组成,与DNA结合,是转录激活的重要组成部分。根据保守域和系统发育关系,MADS-box蛋白可以分为两类:类型I(M型)和类型II(MIKC型)。 类型I包含三个亚家族,Mα、Mβ和Mγ,类型II不仅包含MADS保守域,还包括干预域、角蛋白样域和C-末端域。类型II可以...
MADS-box基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物花器官分化、开花时间调节、以及果实发育等方面起到重要的调控作用[9];其通常分为I型和II型,其中,II型有4个保守结构域:M-domain(MADS-domain)、I-domain(intervening domain)、K-domain(kerat...
摘要:通过生物信息学的方法,利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家族进行鉴定和分析,共得到83个草莓MADS-box候选基因,且MADS-box结构域高度保守。进化分析表明,FvMADS1-FvMADS33可被细分为10个亚组,分别为AG、AGL12、AGL6、AGL2、SE、SVP、FLC、AP3、SOC1、AGL17;FvMADS34-FvMADS83可被细分为...
k-box结构域。通过分析发现, 20个 ncmads-box蛋白序列含有 2 ～ 7个保守基序(图 2 ) 。 2.5 甘松 mads-box蛋白亚细胞定位利用 cello v.2.5在线数据库对 20个甘松 mads-box蛋白进行亚细胞定位预测分析,结果表明甘松大部分 mads-box蛋白定位在细胞核,...
MADS-box蛋白家族是一类N端存在1个氨基酸数目为58～60的保守结构域-MADS-box结构域[4]的重要的转录因子,广泛存在于真核生物中,其名称源自酿酒酵母的MCMI、拟南芥的AGAMOUS、金鱼草的DEFICIENS和人类的SRF4 4种类[5]。常被分为TypeI型和TypeII型,TypeI型包括Mα、Mβ、Mγ、Mδ亚族,目前仅少数TypeI型蛋白的...