madsbox基因家族保守结构域 MADS box基因家族是一类转录因子,它们在植物的发育过程中起着关键作用。这些基因编码的蛋白质包含一个保守的结构域,称为MADS盒(MCM1,AGAMOUS,DEFICIENS和SRF)。这个结构域由58-64个氨基酸组成,其中包含两个高度保守的α-螺旋。 MADS盒结构域的功能主要是识别和结合DNA,从而调控基因的表达...
MADS-box基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物花器官分化、开花时间调节、以及果实发育等方面起到重要的调控作用[9];其通常分为I型和II型,其中,II型有4个保守结构域:M-domain(MADS-domain)、I-domain(intervening domain)、K-domain(kerat...
最近利用Nanopore测序和Hi-C拼接成功将茭白基因组在染色体水平上组装,为分析茭白中的MADS-box基因家族提供了基础。 基于全基因组,本研究鉴定了茭白的MADS-box基因,分析了其物理化学性质、进化关系、基因结构和保守motif,并分析了在不同光周期和温度下茭白叶片和茎顶分生组织(SAM)以及茎瘤初始阶段的MADS-box基因表达模式。
MADS-box基因家族在植物、动物和真菌中广泛存在。MADS-box转录因子具有高度保守的MADS结构域,由56-58个氨基酸组成。根据蛋白质结构,MADS-box转录因子可分为两类,即类型I和类型II。类型I蛋白仅含有MADS结构域,并可进一步分为三个亚类,即Mα、Mβ和Mγ。类型II基因包括动物和真菌中的肌球细胞增强因子2(MEF2)-类...
MADS-box通常有两个保守的结构域:MADS和K结构域(其在pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486),作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,共鉴定出201个M-I-K-C家族成员。 进化树表明家族成员可分成15个亚类,构树时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-box家族基因(下图黑色基因)。
MADS-box基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在植物花器官分化、开花时间调节、以及果实发育等方面起到重要的调控作用[9];其通常分为I型和II型,其中,II型有4个保守结构域:M-domain(MADS-domain)、I-domain(intervening domain)、K-domain(keratin-like domain)和C-domain(C-terminal domain)[10]。
k-box结构域。通过分析发现, 20个 ncmads-box蛋白序列含有 2 ～ 7个保守基序(图 2 ) 。 2.5 甘松 mads-box蛋白亚细胞定位利用 cello v.2.5在线数据库对 20个甘松 mads-box蛋白进行亚细胞定位预测分析,结果表明甘松大部分 mads-box蛋白定位在细胞核,...
1 MADS-box 转录因子 MADS-box 家族因其成员具有保守的 MADS 结构域而得名, 通过形成二聚体或其他复合体形式来调控基因表达[2].MADS-box 是由最先发现 具有 MADS 结构域的 4 种不同生物的首字母命名而来, 分别是酿酒酵母因子 MINICHROMOSOME MAINTENANCE 1(MCM1)[3], 拟南芥花同源异型因子 AGAMOUS[4], ...
MADS-box基因家族基因是一类广泛存在于植物中一种转录因子,高等植物中MADS基因由4个保守程度不一的区域组成, 分别是MADS区、I(intervening)区、K (keratin-like)区和C末端(M-I-K-C domain structure)。根据系统进化可以把MADS-box分为两类: I型和II型。大多数植物MADS基因, 包括所有功能特异的真核生物MADS基因...