2.3. 菊苣蒲MADS-box基因的基因结构和保守基序分析 为了揭示菊苣蒲MADS-box基因的结构多样性,通过将每个基因的编码DNA序列(CDS)与其基因组DNA序列进行比较,利用基因结构显示服务器(GSDS)程序分析了内含子/外显子剪接。如图3所示,属于同一亚组的TkMADS和TmMADS成员的基因结构相似,但是I类和II类基因有所不同。菊苣蒲...
最近利用Nanopore测序和Hi-C拼接成功将茭白基因组在染色体水平上组装,为分析茭白中的MADS-box基因家族提供了基础。 基于全基因组,本研究鉴定了茭白的MADS-box基因,分析了其物理化学性质、进化关系、基因结构和保守motif,并分析了在不同光周期和温度下茭白叶片和茎顶分生组织(SAM)以及茎瘤初始阶段的MADS-box基因表达模式。
另一个主要因素是基因复制,比如水稻中的SEP1亚家族成员OsMADS1和OsMADS5在小麦中分别产生了10个和7个拷贝;而Bisiter亚家族成员OsMADS30在小麦中存在27个拷贝,这些拷贝中很多并不具有完整的结构,很有可能是重复元件转座而导致的基因重复;AGL17和FLC亚家族成员很多基因都跟水稻中的单个基因同源,很可能是由于基因...
作者通过比较小麦不同染色体组(ABD)中家族成员之间的同源性发现,大多数的家族成员在三个染色体组中具有同源基因(1:1:1 ),但也有些家族成员在某个染色体组中缺失,或者是孤儿基因。 MADS-box基因的染色体分布 对小麦MADS-box基因在染色体的分布区域进行统计(分染色体远端(R1,R3)和近端(R2B,C)),大部分的家族成员...
在春化通路中,FLC转录因子作为MADS-box家族核心转录因子之一,是抑制开花的关键,决定着拟南芥冬季开花习性。 FLC通过直接与编码开花激活产物的基因对FLC基因上的表观遗传修饰方式来实现,由于H3K27me3对FLC的修饰标记可持续存在,冷暴露条件下FL的转录表达。
然而,前人的分析多集中在远源进化;其近源的分析少有人做,本研究欲丰富这一不足,聚焦于十字花科植物,以期揭示MADS-box基因家族的十字花科科内进化史。本研究首先分析了目前的27个已测序十字花科物种测序质量并结合现行十字花科植物分类系统确定有代表性的16个物种作为样本,并选取十字花科植物最近源的7个已测序物种...
一、Madsbox 基因家族简介 Madsbox 基因家族是一类在多种生物中高度保守的基因,成员众多且功能多样。这些基因广泛分布于各种生物体中,包括动物、植物和真菌等。家族成员在生物体中发挥着重要的生物学功能,如转录调控、染色质重塑、信号传导和分子互作等。 二、Madsbox 基因家族保守结构域 Madsbox 基因家族成员之间的保...
Madsbox基因家族的保守结构域,即MADS盒,是一种高度保守的蛋白质序列。在自然界中,MADS盒存在于大约40%的植物和15%的动物基因中。这个结构域通常包含约100个氨基酸,具有以下特征:α螺旋、β折叠和多个回旋结构。 【保守结构域在生物学中的作用和意义】 Madsbox基因家族的保守结构域在生物学中具有重要作用。首先,它们...
Madsbox 基因家族是一类含有 Mads-box 结构域的基因,它们在植物中主要参与调控花器官的发育、果实成熟、逆境响应等生物学过程。Mads-box 结构域是一种蛋白质结构域,具有较高的序列保守性,通常与 DNA 结合,从而对目标基因进行调控。 3.保守结构域的概述 保守结构域是指在多个蛋白质序列中具有高度相似性和功能相似性...