这些结果表明,在从二倍体的TKS到三倍体的TM过程中,虽然MADS-box基因的总数并没有增加,但特定亚家族基因显示出显著扩张,例如TM基因组中的Mα亚家族和TKS基因组中的FLC亚家族。 图1:蒲公英和拟南芥MADS-box转录因子的系统发育关系。对拟南芥(黑色)、菊苣蒲(红色)和蒙古菊苣蒲(蓝色)的MADS-box转录因子进行了系统发...
MADS-box通常有两个保守的结构域:MADS和K结构域(其在pfam数据库中的号分别为:PF00319 and PF01486),作者利用pfam号在小麦基因组中查找MADS-box家族基因,共鉴定出201个M-I-K-C家族成员。 进化树表明家族成员可分成15个亚类,构树时也添加了水稻和拟南芥当中的MADS-box家族基因(下图黑色基因)。 比较基因组分析...
最近利用Nanopore测序和Hi-C拼接成功将茭白基因组在染色体水平上组装,为分析茭白中的MADS-box基因家族提供了基础。 基于全基因组,本研究鉴定了茭白的MADS-box基因,分析了其物理化学性质、进化关系、基因结构和保守motif,并分析了在不同光周期和温度下茭白叶片和茎顶分生组织(SAM)以及茎瘤初始阶段的MADS-box基因表达模式。
在春化通路中,FLC转录因子作为MADS-box家族核心转录因子之一,是抑制开花的关键,决定着拟南芥冬季开花习性。 FLC通过直接与编码开花激活产物的基因对FLC基因上的表观遗传修饰方式来实现,由于H3K27me3对FLC的修饰标记可持续存在,冷暴露条件下FL的转录表达。
小麦中著名的开花基因VRN1和AP1就属于MIKC类型的MADS-box基因家族，在小麦春化和开花调控中发挥着重要作用。对该类基因家族的成员进行鉴定和分析，将有助于我们更好地理解该类基因的功能。普通小麦（中国春）中一共鉴定到201个MIKC类型的MADS-box基因成员，其中有164个基因同时含有MADS结构域和K结构域。这两个结构...
通过对以上29个当归MADS-box基因家族蛋白质、61个拟南芥和55个黄胡萝卜MADS-box蛋白质进行结构域和基序分析,结果显示,MADS-box蛋白质分为10个亚家族,与图2系统进化树关系一致,序列含有6个保守基序(表3);当归MADS-box同一亚家族蛋白质基序具有高度相似性,其...
Madsbox基因家族是一类在多种生物体中具有高度保守性的基因,其在植物、动物和真菌等不同物种中发挥着关键作用。本文将对Madsbox基因家族的保守结构域进行详细介绍,并探讨其在生物学中的重要意义。 【Madsbox基因家族的保守结构域概述】 Madsbox基因家族的保守结构域,即MADS盒,是一种高度保守的蛋白质序列。在自然界...
Madsbox 基因家族成员之间的保守性主要体现在它们的结构域上。这些结构域在进化过程中保持高度的相似性,因此被称为保守结构域。保守结构域具有特定的功能和结构特点,可以根据功能和结构特点将其分为不同的类别。 2.1 保守结构域的定义及特点 保守结构域是指在多个蛋白质序列中具有高度相似性和功能相似性的结构域。这...
然而,前人的分析多集中在远源进化;其近源的分析少有人做,本研究欲丰富这一不足,聚焦于十字花科植物,以期揭示MADS-box基因家族的十字花科科内进化史。本研究首先分析了目前的27个已测序十字花科物种测序质量并结合现行十字花科植物分类系统确定有代表性的16个物种作为样本,并选取十字花科植物最近源的7个已测序物种...