MeRIP-seq是将MeDIP、RIP及RNA-seq技术结合起来,在全基因组范围内精确检测RNA甲基化,对RNA样品进行片段化,利用特异性的RNA甲基化抗体进行免疫共沉淀反应,将获得的甲基化修饰片段测序。同时,需要设计Input对照样(类似与ChIP-seq)消除背景。 m7G-meRIP-seq 更多内容 ꅀ 微信...
MeRIP-Seq (m6A-seq, m1A-seq, m5C-seq, m7G-seq) m6A研究背景 m1A研究背景 m5C研究背景 m7G研究背景 服务特点 实验流程 结果展示 m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6...
作为一种重要的表观遗传修饰,m7G RNA甲基化在基因表达、加工代谢、蛋白质合成、转录稳定等方面发挥着重要的作用,参与疾病发生发展等多种生命过程。 对于m7G RNA甲基化修饰的检测,易基因采用基于抗体富集的m7G-MeRIP-seq,利用m7G特异性抗体富集发生m7G甲基化修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高...
m7G修饰RNA中m7G信号的升高进一步支持了METTL1过表达的作用(图4 C)。从m7G tRNA MeRIP-seq中分析tRNA表达表明,METTL1的异位表达提高了大多数m7G修饰tRNA的丰度(图4 D)。考虑到tRNA丰度与蛋白质合成的相关性,本研究有理由推测METTL1可能影响mRNA的翻译。因此,本研究进行了多体分析,以探索m7G tRNA修饰在mRNA翻译...
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图2 结构域的解析 参考文献 [1] Dai Z, Liu H, Liao J, et al. N7-Methylguanosine tRNA modifification enhances oncogenic mRNA translation and promotes intrahepatic cholangiocarcinoma progression. Mol Cell. 2021 Aug 19;81(16):3339-3355.e8....
GenSeq® m7G MeRIP 试剂盒 GS-ET-004 Instruction Manual Version 1.03 (Updated, July 2022) 试剂盒组分 (10 次反应&) 10x Fragmentation Buffer 体积 0.5 mL Stop Buffer 0.5 mL PC Buffer 0.5 mL PC Enhancer 12 µL 5 x IP buffer 5 mL m7G antibodies 22 µL IgG antibodies 11 µL PGM ...
The m7G modification sites are identified using a bioinformatic pipeline that calculates the cleavage scores at individual sites on all tRNAs. Unlike antibody-based methods, such as methylated RNA immunoprecipitation and sequencing (meRIP-Seq) for enrichment of methylated RNA sequences, chemically based ...
Arraystar mRNA&lncRNA表观转录组芯片,可定量检测mRNA&lncRNA中m6A/m5C/m1A/ac4C/m7G/Ψ的表观转录修饰水平。对于m6A修饰,我们提供了两种m6A- RNA富集方法可供选择:m6A抗体免疫沉淀(MeRIP)或GST-YTH pull down富集。 芯片优势 与MeRIP-seq相比,Arraystar表观转录组芯片有其独特的优势: ...
Single-nucleotide resolution profiling of m7G tRNA modifications - GitHub - rnabioinfor/TRAC-Seq: Single-nucleotide resolution profiling of m7G tRNA modifications