m7G-seq利用化学还原和脱氨作用选择性将m7G位点转化为碱性位点,并通过逆转录酶成功检测mRNA中的m7G信号。m7G MAP-seq通过硼氢化盐将m7G位点还原为碱性位点,通过逆转录直接记录为cDNA突变并测序。另一种是化学裂解介导的检测,如碱性水解和苯胺裂解测序(AlkAniline-Seq)和tRNA还原和切割测序(TRAC-Seq)。AlkAniline-Seq...
在综合m7G MeRIP-seq和m7G AlkAnilineSeq结果后,我们发现566个重叠基因在过表达Mettl1后,m7G峰和mRNA表达增加(图4A)。KEGG分析表明,566个重叠基因主要富集于与心脏肥厚相关的信号通路,如AMPK、MAPK和mTOR通路。对566个重叠基因GO分析显示,参与的生物过程与心脏发育、血管生成和DNA损伤有关。此外,一些基因表现出蛋白质...
我们提供两种m7G RNA甲基化测序服务:(1)m7G RNA甲基化单碱基测序(AlkAniline-Seq),可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,我们生物针对m7G RNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-...
This positive selection, embodied in the AlkAniline‐Seq, enables a deep sequencing‐based technology for the simultaneous detection of 7‐methylguanosine (m7G) and 3‐methylcytidine (m3C) in RNA at single nucleotide resolution. As a proof‐of‐concept, we used AlkAniline‐Seq to comprehensively ...
4)AlkAniline-Seq利用碱水解、脱磷、苯胺裂解等化学法在单碱基分辨率上检测m7G位点。 发文章突破点:使用不同的物种、组织或细胞进行m7G实验并测序,然后低通量实验验证。 m7GHub数据库 公共数据库中存在大量m7G数据,m7GHub数据库通过整合这些散在的数据,提供了一个中心化的在线平台,用来破译mRNA内部的m7G RNA修饰的...
我们提供两种m7G RNA甲基化测序服务:(1)m7G RNA甲基化单碱基测序(AlkAniline-Seq),可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,我们生物针对m7G RNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-...
m7G MeRIP-seq分析显示,在过表达Mettl11的心脏中,有3085个上调基因和5372个高甲基化峰。此外,m7G峰值水平与基因表达之间的相关性表明,1520个上调基因的m7G修饰增加。在综合m7G MeRIP-seq和m7G AlkAnilineSeq结果后,我们发现566个重叠基因在过表达Mettl1后,m7G峰和mRNA表达增加(图4A)。KEGG分析表明,566个重叠基因...
3)m7G-seq技术通过利用m7G位点在逆转录期间的错误插入(misincorporation)可以获得单碱基分辨率的m7G位点; 4)AlkAniline-Seq利用碱水解、脱磷、苯胺裂解等化学法在单碱基分辨率上检测m7G位点。 发文章突破点:使用不同的物种、组织或细胞进行m7G实验并测序,然后低通量实验验证。
为了进一步阐明METTL1催化的mRNA内m7G修饰的生物学作用,我们进行了RNA-seq和mRNA内m7G AlkAniline-Seq联合分析(图5E和5F)。然后,我们对敲低METTL1导致mRNA和m7G水平下调的基因进行了功能富集分析,发现这些基因主要富集在癌症等通路的转录失调中(...
3)m7G-seq技术通过利用m7G位点在逆转录期间的错误插入(misincorporation)可以获得单碱基分辨率的m7G位点; 4)AlkAniline-Seq利用碱水解、脱磷、苯胺裂解等化学法在单碱基分辨率上检测m7G位点。 发文章突破点:使用不同的物种、组织或细胞进行m7G实验并测序,然后低通量实验验证。