其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围内对m6A修饰的状况进行系统研究。MeRIP-seq/m6A- seq是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。 二、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验流程 从样品...
M6A-CLIP-seq的基本原理如下: 1.4SU染色:在细胞中加入4SU,使其在RNA合成过程中取代尿苷,并与正在合成的RNA共价结合。 2.光交联:使用紫外线照射细胞,使4SU与相邻的蛋白质交联,并形成共价键。 3.酶切:将细胞裂解,使用核酸酶切割RNA,使蛋白质与RNA分离。 4.免疫沉淀:使用特定的抗体来富集与RNA结合的蛋白质,如...
2. merip-seq技术的原理 merip-seq技术是以m6A修饰的特异性抗体为基础的RNA测序方法。该技术首先利用抗m6A抗体特异性地结合m6A修饰的RNA分子,然后通过抗体-RNA复合物的沉淀和纯化,将m6A修饰的RNA分子与未修饰的RNA分子进行分离。接下来,对分离得到的m6A修饰的RNA分子进行测序分析,从而得到m6A修饰的RNA的鉴定和定位信息...
m6a-clip-seq测序原理 M6A-Clip-Seq是一种用于确定RNA分子上的N6-甲基腺嘌呤(m6A)残基和与它们结合的蛋白质的技术。它结合了CLIP-Seq技术和甲基化内切酶的特性,以分析m6A修饰并分析m6A信号复合物。 。 CLIP-Seq用于检测RNA分子上的结合蛋白质,涉及结合反应的共价交联,接着通过RNA分子的酶切和纯化来进行CLIP-Seq...