MeRIP-seq将RNA上发生m6A修饰的区域富集后进行测序,因此发生m6A修饰的区域,IP文库所覆盖的reads数会显著高于input文库,从而形成“峰(peak)”。检测这些峰的位置即可得到RNA上发生m6A修饰的位置。 鉴定得到m6A修饰后,再对m6A修饰进行注释、分布统计、motif鉴定等分析。 (四) 差异m6A修饰区域的鉴定 差异m6A修饰(即差异p...
2、选择需要委托的服务项目,如MeRIP-seq,则点击进入高通量测序模块。 3、填写需求信息并提交,选择需要委托的测序服务类型MeRIP-seq,并填写样本等信息,直接提交成功。 关于m6A研究背景 请登陆锐博生物官网www.ribobio.com,花3分钟注册一个账户,即可在线委托MeRIP-seq整体服务啦~~~ ...
易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) m6A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq) 高通量m6A甲基...
MeRIP-Seq (m6A-seq, m1A-seq, m5C-seq, m7G-seq) m6A研究背景 m1A研究背景 m5C研究背景 m7G研究背景 服务特点 实验流程 结果展示 m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6...
但是MeRIP-seq只能鉴定m6A高甲基化的区域，并不能做到单碱基的分辨率。送样要求建议为肝脏、脑等转录较...
本研究首先鉴定了RNA碱基修饰N6-甲基腺苷(m6A)在ISG调控中的作用,通过Ribo-seq和定量质谱法结合m6A免疫沉淀测序(MeRIP-seq)分析,鉴定出包含IFITM1的ISG亚群,其翻译通过m6…
一、技术原理：甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验基于表观转录组学，研究RNA上的化学修饰如何调节基因表达。m6A修饰，即腺苷酸N6位的甲基化，是mRNA上含量最高的修饰，参与mRNA的生命周期，如稳定性调控、RNA结构调控和microRNA靶标识别等。m6A修饰主要富集在终止密码子和3’UTR附近，通过特定...
MeRIP-seq/m6A-seq 是最早使用m6A抗体开发的高通量测序技术。该技术通过mRNA片段化成100-200个核苷酸(nt),然后与m6A抗体孵育,洗脱的RNA用于构建文库和测序。甲基化区域在免疫沉淀RNA相对于input RNA的转录覆盖率称为peaks(图1A)。MeRIP-seq/m6A-seq 生成了约200个nt分辨率的m6A信息。MeRIP-seq/m6A-seq操作简单,所...
MeRIP-seq检测22Rv1细胞中DMSO或STM2457组IGFBP3 mRNA 3'UTR的m6A峰分布差异。22Rv1细胞用DMSO、STM2457 2.5μM和10.0μM处理48小时,通过qRT-PCR检测IGFBP3 mRNA水平,并与GAPDH归一化。C4-2细胞用DMSO、STM2457 2.5μM和10.0μM处理48小时,通过qRT-PCR检测IGFBP3 mRNA水平,并与GAPDH归一化。LNCaP细胞用DMSO、...