3.2 m6A-seq、转录组、RIP-seq联合分析锚定YTHDF1靶基因 m6A测序结果表明YTHDF1敲除前后,样本中m6A水平并未出现显著差异。这时候作者对YTHDF1进行了YTHDF1-RIP-seq(联川生物提供)后挖掘到了>2000个 candidate靶基因,通过与转录组及m6A测序进行取交集的韦恩图分析后发现,取交集后靶基因有706个,其中264个出现了下...
做完了RIP-seq、ATAC-seq、m6A-seq等项目,想对基因的某个区域高富集区域绘制peak calling的图,类似于下面展示的几种形式,你会用什么软件呢?当然这里的AI不是人工智能的意思,而是Adobe Illustrator的简称。 今天我们就来一起分享以上这种图是怎么画的?目前有两种方法可以得到——bedtools和IGV都可以做出类似的图,bed...
联合基因科普rip 原标题:用户文章:RIP-seq和m6A-seq联合分析揭示头颈癌铁代谢机制 | RIP专题 中文标题:YTHDF1增强铁代谢依赖于TFRC m6A甲基化 英文标题:YTHDF1-enhanced iron metabolism depends on TFRC m6A methylation 发表期刊:Theranostics 影响因子:8.579 研究机构:浙江大学医学院附属邵逸夫医院 联川提...查看...
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