m6A-seq高通量测序数据分析软件是由武汉康测科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2023SR1435934,属于分类,想要查询更多关于m6A-seq高通量测序数据分析软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
在m6A的多种检测方法中,MeRIP-seq是目前运用最多的方法,它的全称是甲基化RNA免疫共沉淀高通量测序。其原理是通过m6A抗体富集在发生m6A甲基化的RNA片段,再对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,在全转录组范围内研究发生m6A甲基化修饰的区域,进而开展下游的研究。 在了解了m6A RNA甲基化修饰之后,如何开展与之相对应的...
5 分左右文章,通常做一个高通量的筛选也就是 m6A-seq(或 MeRIP-seq),在基础分析报告的情况下简答挖掘描述一下,就可以发一篇文章啦,还算是比较轻松。 5分 < 影响因子 <12 分 12 分 < 影响因子 <20 分
Venn 图 更为重要的是,为了解决前期 m6A-seq 检测的盲目性等问题,基于质谱分析的 m6A 检测也在紧锣密鼓的研发测试中,预计很快就可以为广大客户提供检测服务。下一期我们就会给大家来揭秘 m6A-seq 新的促销内容啦,搓小手期待下。 微信原文:https://mp.weixin.qq.com/s/rtDPFMhZszQN3w9HZWeLIQ 更多伯豪生物服...
这种技术被称为miCLIP-seq。 miCLIP-seq操作第一步对富集完的mRNA进行片段化。 第二步,使用带有m6A抗体免疫磁珠与带有m6A的mRNA片段进行结合。 第三步,使用紫外交联进行免疫共沉淀后,在mRNA片段的3’端连上接头序列,在5’端加上P32放射性标记后进行移膜。
结果表明,m6A修饰在 拟南芥中是一个动态的过程(案例解析:m6A-seq揭示拟南芥RNA甲基化独特特性 | m6A专题)。 其他几项研究均证实,带m6A修饰的腺嘌呤可通过去甲基化酶ALKBH9b和ALKBH10b的作用下还原为不带有m6A修饰 的腺苷(案例解析:拟南芥去甲基化酶ALKBH10调控成花转变 | m6A专题)。ALKBH9b定位于在有siRNA的...
7.s1,m6a-seq高通量测序数据进行处理,过滤掉不合格的序列,其中,所述m6a-seq测序数据来自至少一对配对的ip样本和input样本。其中ip指的是m6a测序中免疫沉淀immunoprecipitation的缩写,input是m6a实验中的一种阳性对照。input样本不进行ip实验,可以帮助判断m6a的ip效果,通过input和ip对比,判断m6a修饰程度大小及实验效果; ...
(1)高可信度数据:基于破坏RNA修饰位点序列并以miCLIP、PA-m6A-seq和m1A-IP-seq等实验获得的RNA修饰...
假基因是一种失去了蛋白编码能力或者表达能力的基因,通常由基因重复产生,基因组上的DNA重复可以形成非加工型假基因,而逆转录形成的基因重复会形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白产生细胞毒性,因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC,因此大量的非加工型假基因可以通过NMD的方式降解。然而,加工型...