图1:m6A甲基化和去甲基化示意图 目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)的方法,其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 服务...
采用m6A-seq(MeRIP-seq)测序方法,对猪骨骼肌发育六个胚胎期的纵向转录组和表观转录组图谱进行分析。 结论 MeRIP-seq结果显示:胚胎期骨骼肌发育六个不同阶段的m6A修饰呈现高度的动态变化,且大多数受影响的基因在与骨骼肌发育相关的通路中富集。IGF2BP1 RIP-seq证实了胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)靶向...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)发现sp8阳性的神经元中YTHDF1的表达下降在中间神经元中最为明显,而这部分神经元,后续会发育成VIP中间神经元。YTHDF1的功能主要是识别RNA上的甲基化位点。通过RIP实验(RNA结合蛋白免疫沉淀)和m6A-seq测序分析发现m6A被高度富集在突触素(Synaptophysin)的mRNA上,同时Synaptophysin的mRNA上有Y...
IGV基因峰图 多组学关联分析四象限图(RNA-seq与meRIP-seq) 送样要求 样本物种: 仅限人、大小鼠物种,其他物种需评估 500ng--20ug 总RNA 5x10⁶~10⁷ 细胞数量 10~20mg 组织质量 基础与高级分析 基本分析 1.测序原始reads去接头,质量控制(QC) 2.参考基因组比对(Mapping) 3.富集区域鉴定(PeakCalling) 4...
MeRIP-Seq是通过能够识别RNA m6A修饰的特异性抗体结合具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,然后对富集下来的RNA片段进行高通量测序的技术,实现在全转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 服务流程: (1)实验设计 (2)免疫共沉淀RNA样品制备 (3)测序文库构建
M6A-CLIP-seq将CLIP技术和高通量测序技术结合起来,用于研究RNA甲基化修饰m6A(N6-methyladenosine)的分布以及其与蛋白质的相互作用。m6A是一种常见的RNA内部化学修饰,在真核生物的转录和剪接中具有重要的功能。M6A-CLIP-seq可以帮助研究人员鉴定与m6A修饰相关的蛋白质,并确定它们与RNA的相互作用的位点和序列。 M6A-CLIP...
高灵敏度：总RNA起始量只需10微克，甚至1微克，即可进行检测。广泛应用领域：适用于组织发育、干细胞研究、应激反应、癌症机制及药物反应等多种领域的研究。适用样本类型：可用于动物、植物和细胞组织的m6A检测。技术创新：MeRIPseq2技术：易基因创新开发的MeRIPseq2技术提高了免疫沉淀平行性，实现不同样本的...
综上,scm6A-seq技术实现了单细胞中m6A甲基化组和转录组的同时测序。利用scm6A-seq技术,鉴定出了高质量卵母细胞(SN)和低质量(NSN)卵母细胞,提示scm6A-seq技术具备更精确鉴定单细胞亚群的潜力。
最后为了进一步证明该方法的多功能性,将picoMeRIP-seq应用于荧光激活细胞分选的mES细胞,实验结果具有良好的重复性和非常好的m6A峰,但没有获得足够的文库进行测序,后续可以尝试进一步优化。 图1 最终对picoMeRIP-seq进行基准测试,将该方法应用到单个小鼠受精卵和着床前胚胎(双细胞,八细胞和囊胚阶段的单小鼠生发囊泡阶段...
m6A主要发生在终止密码子和3’UTR附近，参与调控mRNA的稳定性、二级结构、microRNA靶标识别以及基因表达调控等。MeRIP-seq/m6A-seq技术通过特异识别m6A修饰的抗体，对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀，然后高通量测序，结合生物信息学分析，可在全基因组范围内系统研究m6A修饰状况。二、甲基化RNA...