报道了一种称为m6A-label-seq的高通量测序方法,通过细胞自身代谢对全转录组RNA m6A位点进行标记,标记位点可发生化学处理诱导的逆转录碱基突变,进而实现单碱基分辨率测定。
近年来陆续开发的m6A测序方法(如Mazter-seq, m6A-REF-seq, DART-seq, m6A-SEAL, m6A-label-seq等)也只是部分解决了上述提及的局限性。 2022年3月15日,复旦大学生物医学研究院胡璐璐研究员与芝加哥大学何川教授、美国希望之城陈建军教授和芝加哥大学陈梦洁教授合作在Nature Biotechnology杂志上发表了题为m6A RNA mod...
浙江大学刘建钊研究员课题组开发了一种基于细胞代谢标记的全转录组RNA高通量测序方法,简称m6A-label-seq,来获取m6A单碱基分辨率信息。 北京时间2020年4月27日晚23时,Nature Chemical Biology杂志以长文发表了该测序方法,题为“Ametabolic labeling method detects m6A tranome-wide at singlebase resolution”。 在m6A...
m6A-label-seq provides a strategy to label and identify cellular epitranscriptomic modification sites.doi:10.1016/j.xpro.2021.101096Xiao ShuJie CaoJianzhao LiuSTAR Protocols
今天介绍两种不依赖m6A抗体的RNA m6A修饰位点鉴定新策略:m6A-label-seq与m6A-SEAL-seq。 m6A-label-seq [1] 通过细胞自身代谢对全转录组RNA m6A位点进行标记,转化为N6-烯丙基腺嘌呤(a6A),a6A进一步通过化学处理转化为1,6位环化腺嘌呤(cyc-A),依靠cyc-A在逆转录过程中引入的碱基突变,进而实现...
基于酶法:MAZTER-seq和m6A-REF-seq依赖MazF核糖核酸内切酶检测m6A位点,由于该酶只检测ACA内的m6A位点,因此具有序列偏好性缺乏检测灵敏度。化学法检测m6A:DART-seq、m6A-SEAL-seq和m6A-label-seq为m6A检测提供了新的选择,但它们仍然缺乏化学计量信息。 2022年10月27日,北京大学王晶与伊成器课题组联合在Nature ...
近年来陆续开发的m6A测序方法(如Mazter-seq, m6A-REF-seq, DART-seq, m6A-SEAL, m6A-label-seq等)也只是部分解决了上述提及的局限性。2022年3月15日,复旦大学生物医学研究院胡璐璐研究员与芝加哥大学何川教授、美国希望之城陈建军教授和芝加哥大学陈梦洁教授合作在Nature Biotechnology杂志上发表了题为m6A RNA ...
近年来陆续开发的m6A测序方法(如Mazter-seq, m6A-REF-seq, DART-seq, m6A-SEAL, m6A-label-seq等)也只是部分解决了上述提及的局限性。2022年3月15日,复旦大学生物医学研究院胡璐璐研究员与芝加哥大学何川教授、美国希望之城陈建军教授和芝加哥大学陈梦洁教授合作在Nature Biotechnology杂志上发表了题为m6A RNA ...
近年来陆续开发的m6A测序方法(如Mazter-seq, m6A-REF-seq, DART-seq, m6A-SEAL, m6A-label-seq等)也只是部分解决了上述提及的局限性。 2022年3月15日,复旦大学生物医学研究院胡璐璐研究员与芝加哥大学何川教授、美国希望之城陈建军教授和芝加哥大学陈梦洁教授合作在Nature Biotechnology杂志上发表了题为m6A RNA ...
2020年4月27日,浙江大学高分子科学与工程学系刘建钊课题组在Nature Chemical Biology上长文发表题为A metabolic labeling method detects m6A transcriptome-wide at single base resolution的研究,报道了一种称为m6A-label-seq的高通量测序方法,通过细胞自身代谢对全转录组RNA m6A位点进行标记,标记位点可发生化学处理诱导...