研究方法:ChIP-seq、CUT&Tag、蛋白质组学分析(LC-MS)、m1A MeRIP-seq、 RNA-seq、RIP-qPCR、荧光素酶报告实验、 多聚核糖体分析(Polysome profiling) 研究摘要 尽管m1A RNA修饰是RNA代谢的重要调节因子,但m1A修饰在癌变中的作用仍然是谜。本研究发现,组蛋白乳酸化通过去除SP100A的m1A甲基化,增强了ALKBH3的...
研究方法:ChIP-seq、CUT&Tag、蛋白质组学分析(LC-MS)、m1A MeRIP-seq、RNA-seq、RIP-qPCR、荧光素酶报告实验、 多聚核糖体分析(Polysome profiling) 研究摘要 尽管m1A RNA修饰是RNA代谢的重要调节因子,但m1A修饰在癌变中的作用仍然是谜。本研究发现,组蛋白乳酸化通过去除SP100A的m1A甲基化,增强了ALKBH3的表...
根据MeRIP-seq和RNA-seq数据的组合分析构建维恩图,显示AC-(Br+6)与AC-MG和Nr-O与Nr-G对照组中具有差异m1A甲基化和差异表达的mRNA(图6c),显示AC-(Br+6)与AC-MG和Nr-O与Nr-G对照组中具有差异m1A甲基化和差异表达的常见和特异性mRNA。虽然在两个比较组中,大多数常见的DE mRNA的m1A修饰水平均呈现出一致...
为了研究人细胞转录组中的m1A修饰,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其广泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段,发展了“m1A-ID-seq”一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术,该研究成功实现了人细胞系全转录组水平...
细胞培养,点印记,免疫荧光,WB,RNA提取和qRT-PCR,质粒构建,慢病毒的包装和稳定细胞系的产生,细胞增殖,克隆形成,Transwell,异种移植物模型,ChIP-seq,CUT&Tag,MeRIP-seq,RNA-seq,iTRAQ蛋白组学分析,RIP-qPCR,荧光素酶报告实验,多肽体谱 参考文献 Gu X, Zhuang A, Yu J, Yang L, Ge S, Ruan J, Jia R, ...
对m5C RNA甲基化,目前最流行的检测手段为m5C-Seq技术,适用于m5C RNA甲基化谱研究,快速筛选m5C RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m5C测序: m5C 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA) m5C LncRNA测序(涵盖LncRNA和mRNA) m5C Pri-miRNA测序(涵盖Pri-miRNA和mRNA) ...
m1A RNA甲基化测序(m1A-seq) 对m1A RNA甲基化,目前最流行的检测手段为m1A-Seq技术,适用于m1A RNA甲基化谱研究,快速筛选m1A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m1AC测序: m1A 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA) m1A LncRNA测序(涵盖LncRNA和mRNA) ...
m1A RNA甲基化测序(m1A-seq) 对m1A RNA甲基化,目前最流行的检测手段为m1A-Seq技术,适用于m1A RNA甲基化谱研究,快速筛选m1A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m1AC测序: m1A 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA) m1A LncRNA测序(涵盖LncRNA和mRNA) ...
随着NGS的广泛应用,RNA修饰得到了广泛研究,已是表观遗传领域的热点之一,而MeRIP-seq则是研究m1A修饰强有力的技术之一。该技术是将MeDIP、RIP及RNA-seq技术结合起来,在全基因组范围内精确检测RNA甲基化,对RNA样品进行片段化,利用特异性的RNA甲基化抗体进行免疫共沉淀反应,将获得的甲基化修饰片段测序。同时,需要设计...
直到2016年,来自芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文,该研究通过m1A RNA甲基化测序和RIP测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行全面的分析,揭示了一种小型的化学修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。这种小型的修饰具有进化保守性,而且在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在,但其位置...